在无名网络游戏的世界中，转生到最高难度“地狱模式”的前废人玩家少年亚莲。没有攻略本，没有论坛。连练级都是赌上性命——面对如此绝望的环境，他身为玩家的本能却为之雀跃。凭借转生时获得的独一无二且充满谜团的才能“召唤士”的能力，以及前世的知识，一次次突破死线的亚莲，虽出身农奴，却得以成为贵族格兰威尔家的“客人”。而新的舞台——拉塔什王国学园都市。在学园中等待着的是新的伙伴、与人类最强勇者赫米奥斯的相遇，以及梦寐以求的组队攻略地下城……等等。然而这个世界无论走到哪里都是“地狱模式”。在新的舞台上，前废人玩家将展开超高难度的异世界冒险谭——大幕再次拉开！！
本作主人公冈部伦太郎（宫野真守 配音）是个患有严重中二病的大学生，自称为“凤凰院凶真”的他和伙伴们组成了“未来发明研究所”，在位于秋叶原的一个简陋实验室内进行各种古怪发明和调查。 2010年7月28日这天，冈部和青梅竹马真由理（花泽香菜 配音）一同去了科学讲义会场，在那里，他们遇见了天才少女牧濑红莉栖（今井麻美 配音）。让人意想不到的事情发生了，冈部在会馆楼道内听到一声惨叫，他闻声而至，发现了倒在血泊中的牧濑。冈部用手机短信将这件事告诉好友桥田至，这个举动，让世界都颠覆了。实验室里那个所谓的“未来道具”，竟然真的可以左右世界的进程，冈部自此成了孤独的观测者。 这一切都是命运石之门的选择。
上古时期妖兽纵横，一位神秘道人分别授予了阴阳五行的特殊能力给金木水火土五个家族来抵抗妖兽，他们将妖兽驱赶到神隐雾山之中，设立结界。 雾山之中另有被封印于巨阙神盾之中的具有强大灵力的麒麟兽，常常吸引来那些想要提升妖力突破结界的妖兽。火行使者闻人翊悬为救其母私自打开了巨阙神盾，小麒麟趁机偷溜出来，妖兽界将掀起一 股腥风血雨......
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
