1614年，德川家康73岁，年迈的他必须在两个儿子之间为他的将军之位选一名继承人。难以决断的德川家康将决定的权利交给当时势均力敌的两大忍术宗家，它们分别是甲贺流和伊贺流。在前人服部半藏的调解下，曾经水火不容的两家签下了“不战条约”，但在权利和政治的挑拨之下，条约被撕毁了。 两家各派出十名忍者，他们要相互残杀直至仅剩一方幸存，而幸存方所支持的对象即可成为下一代将军。其中，甲贺流的头领甲贺玄之介（鸟海浩辅 配音）与伊贺流的头领胧（水树奈奈 配音）在战前曾经是两情相悦的恋人，与此同时，甲贺流与伊贺流的一些成员之间也有着复杂的感情纠葛。但是此时此刻，仿佛被丝线牵引的人偶，他们必须摒弃所有的感情，展开一场血腥残酷的厮杀。
“上界之路，千难万险；破灭神国，踏平寰宇。千锤百炼，终将成神！” 罗征为复活挚爱宁雨蝶，踏上前无古人的逆天之路！天羽秘境与天穹生隙反目，却于神弃塔下并肩相守。爱恨难明，红颜淬骨；百炼封神，顺逆由己。飞升上界的罗征，势要挣脱天命枷锁，终成寰宇唯一天命人……然而，天命之外的死劫正悄然降临！
千年前的魔界霸主元邪皇顺利复活降临中原，席卷佛国，欲星移承接法海天命，化身第109位大智慧，与缺舟一帆渡一同剑起文殊，奋力诛邪，无奈邪皇魔威赫赫，千年修行的大智慧依旧不敌。 至此，佛劫终止，魔劫再开。 千年之后，再次一统魔世，麾下更有长琴无焰，应龙师等一干高手的元邪皇，即将再为九界掀起杀潮。 痛失师相的太虚海境，狼主回归的苗疆，百废待兴的中原，历经地门波折的佛国，神秘莫测的道域，隐而不出的羽国 分别又将在这场惊天魔灾中走向何方？俏如来，公子开明是否能力挽狂澜？雁王，凰后又是否会趁机再开墨乱？
