沉睡万年的辰南从神魔陵园醒来，在经历了一系列奇遇后名动四方。随着辰南来到央锦国遇到晨曦，新的冒险再次开启，在开元城大战、到死亡绝地寻找身世之谜、大战凌家只为求一个公正清明。在这一季，辰南会在探寻身世之谜的冒险当中不断搜寻雨馨的踪迹。
TV动画『入间同学入魔了』第3季制作发表
21世纪，地球回复昔日的和平，但此时宇宙坠下一颗陨石，陨石有一个人工的时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊了解到地球将有大灾难发生。而此时，时空囊预言的两大怪兽·“哥路渣”和“米路巴”先后出现，GUTS小队便根据预言寻找收藏在金字塔的三大巨人的身体。 几经寻找后GUTS队员们终于找到金字塔，但两大怪兽也到来了。虽GUTS拼死守护，但三个巨像已被破坏剩一个，队员·大伍的战机也被击中，且逃生装置失灵。在危急关头，大伍突然化成光，和最后一个的石像结合。光之巨人“迪加”因此而复活，并与两大怪兽展开了战斗……
当宁远发现自己被困死牢灯塔，钉墙不断逼近，而一墙之隔还关着女医学生苏瑾……奋力逃生并如约救出苏瑾后，坠海、失忆、面对敌人，一系列危险接踵而至，只有小学五年级记忆的宁远和善良胆小的苏瑾，在友情和义气、背叛与猜忌中如何自保？ 魔术师、医学生、香港黑道、日本总裁……身份 各异素未谋面的人一梦惊醒，发现已经身陷荒岛，无法联系外界的他们面对种种危机，如何逃生？原始部落、神秘文明、变异病毒、诡异生物，在这座死亡之岛上无从梦中醒来的宁远，发现自己被关入死牢，除了不断靠近的钉板墙和同囚的女性，他一无所知。好不容易逃离死牢的他发现自己被送到了迷域之中的杀戮游戏中，要如何才能逃离迷域，逃离这个死亡游戏？
表面看来，安艺伦也（松冈祯丞 配音）只是一个平凡的少年，实际上，他还有另一重身份——同人游戏社团“Blessing software”的制作人。一次偶然中，伦也邂逅了名为加藤惠（安野希世乃 配音）的可爱女孩，发现了加藤惠独特魅力的伦也，决定让她成为自己制作的GAL游戏的女主角。 伦也的青梅竹马，拥有校园精英和邋遢家里蹲双重面目的英梨梨（大西沙织 配音）、寡言少语，曾出版过超畅销恋爱轻小说的学姐霞之丘诗羽（茅野爱衣 配音）、乐队“icy tail”的主唱，对二次元文化抱有偏见的冰堂美智留（矢作纱友里 配音），这些性格迥异的女孩们接连加入了伦也的游戏制作计划中。
