这是一个全民直播的时代，流量即金钱，弱鸡刘明浩误打误撞通过“打架”视频走红网络，开始了直播之路。为了赚钱还清欠款，需要足够“抗揍”，为此，他点开了一个神秘的账号，这个账号专门上传格斗技巧的教学视频。今天也励志成为不挨打又能赚钱的主播~
在第二次新吉恩战争、别名“夏亚的叛乱”终结后，地球圈取得了短暂的和平。 这之后3年，宇宙世纪0096年。在工业殖民地“工业7号”上进行了一项秘密交涉。内容为－－被认为是地球联邦政府暗中操控的“比斯特财团”将把最高机密“拉普拉斯之箱”交给新吉恩的残党军“袖付”。 另一方面，在安纳海姆工业专门学校就读的少年巴纳吉·林克斯遇见了自称为奥黛丽·本的少女（实为旧吉恩公国次男多兹鲁·扎比之女，美耐巴·扎比）奥黛丽为了制止新的战争爆发，必须组织“拉普拉斯之箱”的交易。巴纳吉在数次帮助奥黛丽之后，逐渐被她所吸引。 随后，地球联邦察觉了这起交易，并进行军事介入，工业殖民地随即化为一片火海。巴纳吉和同伴一边避难一边寻找着奥黛丽，而出现在他面前的是比斯特财团的当家卡迪阿斯·比斯特。奄奄一息的卡迪阿斯将出生的秘密告诉了巴纳吉，并且将箱之钥匙－－“机动战士高达独角兽”托付给他。 随后，一场围绕“拉普拉斯之箱”的战争开始了……
青春学园网球部称霸全国的目标又向前迈进了一步。代表中学网球最高水平的全国大赛开始了。之前饱受伤病困扰的部长手冢国光（置鲇龙太郎 配音）彻底愈合回归，而越前龙马（皆川纯子 配音）也从美国回到了日本，声称自己只是来加油的。青学迎战的第一场是来自冲绳的六角中学。六角中学故意伪造意外事故，让青学陷入了困境，为了能让青学获胜，大石（近藤孝行 配音）决定让龙马替自己征战。经过一番苦战，青春学园进入到了下一轮，而面对他们的是老对手——冰帝。这将是一番苦战！除此之外，之前在正片中出场的各大学校也将登场，进行最激烈的全国大赛。 本片改编自许斐刚的同名热门漫画全国大赛卷。
小学时期，游泳部的四名成员在毕业前的游泳比赛中夺冠，之后他们毕业的毕业，出国的出国，四人分道扬镳。时过境迁，就读岩鸢高中的七濑遥（岛崎信长 配音）和好朋友橘真琴（铃木达央 配音）升上高二，他们与昔日的游泳部成员之一叶月渚（代永翼 配音）重逢。三人回忆起小学时光，约定到曾经的游泳馆去。在废弃的游泳馆里，他们居然遇到了归国的松冈凛（宫野真守 配音）。意料之外的是，昔日战友凛性情大变，还对遥发起挑战，结果遥输给了他。 遥、真琴和渚决定成立游泳部，经过多番努力后，终于招募到了新成员龙崎怜（平川大辅 配音），他们以县大赛冠军为目标，进行紧张的集训。另一方面，凛所在的鲛柄学院游泳部也在为大赛作准备。他们约定，要在赛场上决一高下。充满激情和活力的游泳部，在这个夏天，开始了关于友情与青春的Free!故事。
