因偶然事件为契机与世界第一的英雄欧尔麦特相遇的“无个性”少年绿谷出久，身体内继承了欧尔麦特的个性，具有了成为英雄的资质。在经过严厉的训练后，绿谷出久成功进入了雄英高中入学，在与爆豪胜己、丽日御茶子等英雄科1年A班的同学们一起在互相切磋和学习中度过每一天。在这种情况下，全国瞩目的活动“雄英高中体育祭”来临了。目指第一的爆豪胜己，因为家族原因具有强烈意志的饭田天哉，为了否定父亲而渴求胜利的轰焦冻，以及英雄科1年B班的成员...。雄英高中所有同学都气志高涨，绿谷出久也重新下定了决心。“我也会全力去比赛的！“ 以最顶级的英雄为目标的学生们，“个性”、力量和自尊的战斗拉开了序幕！！
故事讲述在町田的住宅地附近，由于大范围的地盘下沉产生了巨大的“穴”。同时，居住在当地的185家人家无一例外地被残忍的杀害。迷一般的恐怖杀人事件一件一件发生，怎么看也不像是人类乾出来的，却一点线索也没有。这些事件似乎和一个迷之老人以及一个被称为禁忌之遗物的“ドゥルジ之箱”有着什么关联。过了5年，近未来的东京。表面上看上去是座繁荣的巨大都市，实际上却已经走向了毁灭的边缘。两极化，犯罪都市。町田惨剧中唯一一个生还者申道兰丸，为了寻找事件的真相成为了警察。然后，新的案件还是在涩谷发生了。有报道称，这是一个吸毒者的狂暴案件，但在申道等警察赶到现场时，眼前清楚的看到正在蹂躏人的妖兽。上前救人的是特殊机动搜查队2课，特殊公安部，通称“特公”的队员，六条樱她们。她们的武器既不是枪也不是警棍，而是用来斩杀妖兽的太刀。申道终于明白日本将在2年内毁灭，于是走上了和妖兽战斗的悲惨道路……
动画剧情舞台为2047年，与人类之敌「D2」对抗而荒废的美国。指挥家「朝雏タクト」与「Musicart」的少女「命运」，在失去音乐的世界中各自为了自身的渴望，共同出发前往纽约。
