改编自同名轻小说作品，动画以魔族与人共同生活的街道为舞台，讲述了为各种魔物娘们看病的新人医生和医生的助手的日常生活故事。
选徒仪式前突然造访， 行事神秘的翩翩公子是何身份； 九重死地深处的灵神古墓， 是否真的存留有破碎神格？ 路途坎坷，险象迭生！素不相识的两位少年将如何携手克服重重困难？
在这个世界中，存在着一种“中间人”，他们可以吸收自杀者的生命粒子，并利用这些生命粒子延续濒死之人的生命。“中间人”叶晰的搭档尚敏突然失踪，在寻找尚敏的过程中，他发现了自己所处的组织的一些不为人知的黑暗。而这些，都和一个名为“克洛托”的计划有关……
表面上看来，索尼娅（田村睦心 配音）是一个扎着双马尾的金发美少女高中生，但实际上，她有着一个秘密的身份——杀手。作为一名杀手，索尼娅有着异常敏锐的神经，任何突然靠近她的生物，都会受到她的强力攻击。少女折部安奈（赤崎千夏 配音）自称是索尼娅的朋友，但似乎没有得到索尼娅的认可。因为其大大咧咧的天然呆个性，安奈经常成为索尼娅本能攻击的受害者。 在无意间，安奈发现，虽然索尼娅是个令人闻风丧胆的杀手，但她在昆虫和妖怪方面却有着意外小的胆量，这也成为了拉近二人关系的重要契机。同时，索尼娅的杀手同事吴织亚切（高部爱 配音），毫无存在感的不知名少女（钉宫理惠 配音）也来到了安奈的身边，杀手和少女们热闹的日常生活展开了。
5月15日12点《灵笼》特别篇将上线，带领观众走进未知的地面世界，揭开神秘的地面人生活。
