《黑子的篮球》故事主要围绕两位主人公——被誉为第六位“奇迹世代”的黑子哲也以及从美国归来的天才篮球选手火神大我展开，两人在球场上市光与影的搭档。相遇后的他们将挑战其他五位“奇迹世代”。
曹焱兵一行因芦花古楼的覆灭被皇甫龙斗领导的天罡龙棋将栽赃嫁祸，全员受到灵域的通缉，在经过“天武街”和“风雷街”时，他们分别遭遇了王国组织的第三骑士红莲与第十骑士凯米拉。其后，曹焱兵为探寻母亲下落，故意被缉拿至由群英殿镇守的死牢“千机黑刹”。而其伙伴们为救曹焱兵，在多方驰援下，各方势力齐聚群英殿，展开了一场精彩绝伦的群英荟萃之战。
故事发生在一个与世隔绝的村庄——外场村。多年以来，村庄一直维持着最为古老的殡葬方式——土葬。这为一种名叫“尸鬼”的怪物的生成提供了得天独厚的良好环境。尸鬼，僵尸的一种，它们身强体壮但惧怕阳光，靠吸食人类血液为生，同时以将普通的人类变成尸鬼来扩充己方的实力，它们的目的只有一个，那就是彻底占领外场村。奇怪的事情在村子各处隐秘的发生着，谁也没有将它们联系到一起，当恐惧爆发的时候，一切都已经为时已晚。结城夏野（内山昂辉 配音）是第一个发现尸鬼存在的人，而当他被尸鬼攻击后，却变成尸鬼的亚种“人狼”，人狼除了身体素质强于常人外，与人类无异，因此，人狼成为了唯一能够和尸鬼抗衡的存在。 在这个小小的村落中，在恐惧与鲜血的包围下，尸鬼的领袖桐敷沙子（悠木碧 配音）和人狼的领袖结城夏野之间，淳朴的村民和嗜血的魔物之间，即将展开一场惨烈的战争。
这是一个魔女与人类共存的世界，为了保证魔女的身份不被揭穿，被人类发现了真实身份的魔女都会变成魔女青蛙，唯有另一个拥有正式身份的魔女才能够解开魔法。一次偶然中，一直梦想者能够成为魔女的少女春风Doremi（千叶千惠巳 配音）撞破了魔女莉卡的身份，无奈之下，莉卡只得将春风收为见习魔女。春风必须经历漫长而艰苦的修炼，通过魔女的考试才能够正式获得魔女资格。 在此之后，成熟稳重，性格文静的藤原羽月（秋谷智子 配音），精明强干活泼好动的妹尾爱子（松冈由贵 配音），傲娇跋扈但内心善良的濑川音符（宍戸留美 配音）春风的妹妹春风泡泡（大谷育江 配音）等人都因发现了春风的身份而接连成为了见习魔女。随着时间的流逝，对于女孩们来说，通过魔女考试反而成为了次要目的，最重要的是，一定要利用各自的魔法能力让人们获得幸福。
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