《茶啊二中第六季》时间线来到初三，欢乐的校园日常仍在继续，孩子们迎来了老师、家长们更多的“关爱”，也面临着新的成长挑战，这一季中，大家在校园和家庭生活过程中发生的点滴小事里，凝聚了师生情、友情、亲情的力量，展示了一群平凡却又特别的初中生有笑有泪、真挚动人的青春成长故事。
潜伏的怪物威胁、异世界的怪物，砂糖人。 人们并不知道，它们已经秘密进入了人间界。 人们也不知道，它们正袭击和绑架人类。 为了保护人类，一位青年挺身而出！ 那是一位非常喜欢吃东西的青年——生真。 通过吃下糖果，生真能创造出成为其眷属的存在「饱藏」，并获得变身为假面骑士的力量。 现在，生真为了保护人们的幸福而与砂糖人战斗的故事开始了！
药谷完治（丰崎爱生 配音）是一名现代日本药学研究者，哪知道在误打误撞之中，竟然转生来到了异世界，成为了宫廷药师名家的儿子法尔玛。这是一个无论是药学还是科技都落后于现代的世界，可是在这里，完治获得了只有这个世界才有了神奇魔力。 于是，完治决定运用自己获得的能力，以及在原本世界里所拥有的药理学知识，来纠正存在于这个世界的对于治疗方法和药物调配的错误认知。在此过程中，完治邂逅了父亲的第一大弟子艾兰诺（上田丽奈 配音）以及和母亲一起侍奉自己家族的夏洛特（本渡枫 配音）。
