世界顶级葡萄酒评论家神咲丰多香去世以后，留下了价值20亿日圆的丰厚遗产和一封遗书。在遗书中他宣布，只有以“盲饮”方式猜中他指定的十二瓶顶级葡萄酒（“十二使徒”）以及第十三瓶梦幻之酒（“神之雫”）的酒名和年份，并且将这些葡萄酒的内涵表现出来的人，才能继承遗产。
曾几何时，一个神秘奇怪的生物（关智一 配音）将月球的70%蒸发掉，并且扬言在次年的3月破坏地球。为了捍卫地球，各国政府出动军队，调派最先进的武器攻击这个可怕的怪物，可是他们用尽了各种办法，却没有起到任何效果。谁知就在恐慌逼近的时候，该生物竟然来到椚丘中学3年E班担任老师，以潮田渚（东山奈央 配音）、赤羽业（冈本信彦 配音）为首的学生们各显其能，试图干掉这个“杀老师”，无奈对方拥有20马赫的速度，杀他几乎成为一件不可能的任务。平静的日子缓缓流淌，学生们丝毫没有放弃暗杀老师的念头。这一天，京都的修学旅行即将举行，少男少女各自组队，准备迎接快乐的时刻，同时策划对“杀老师”进行新一轮的暗杀…… 本片根据松井优征的漫画改编。
こんな未来があったらいいな、と思わず言いたくなるような近い将来のとある港町――萌桜町。 町の顔ともいえる電子機器メーカーの大手ＡＭＢカンパニーが、動物によるアニマルセラピーならぬ 美少女アンドロイドによる萌えセラピー効果を狙いとした新サービス、『萌えＣａｎちぇんじ！』をスタートすることが発表され、 おおいにわき返る町の一角でその広報を担当する、通称「ナビ嬢」に選ばれた喜屋武知恵と萌木杏奈は今日もリハーサルに励んでいた ――といってもノリノリなのは知恵だけだったが。そんな二人の仲睦まじい（？）様子を物陰から伺う人影が。 不思議な力を発揮するスマートフォンや食べたらびっくりのケーキ屋さんに迷いこんじゃったりと、 二人のまわりでは次々とトラブルが巻き起こっていく。裏で暗躍する（？）謎の二人組もいて…… 人気携帯ゲーム『萌えＣａｎちぇんじ！』の世界観を、キャラクターたちのひと騒動を通して描くフレアイパワフルコメディＯＶＡ。 ──世界は萌えで変革する──
