在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
敬文的舅舅在昏迷17 年后突然苏醒过来，已届中年的舅舅开口说出无法辨认的语言，而且还能使用魔法。
圣杯是传说中可实现持有者一切愿望的宝物。而为了得到圣杯的仪式就被称为圣杯战争。 参加圣杯战争的7名由圣杯选出的魔术师被称为Master，与7名被称为Servant的使魔订定契约。他们是由圣杯选择的七位英灵，被分为七个职阶，以使魔的身份被召唤出来。能获得圣杯的只有一组，这7组人马各自为了成为最后的那一组而互相残杀。 卫宫切嗣的养子卫宫士郎，偶然地与servant中的剑士Saber（セイバー）订定契约，被卷入圣杯战争当中...
《鬼灭之刃 柱训练篇》主要讲述的是九柱集训的故事，包括岩柱悲鸣屿行冥，炎柱炼狱杏寿郎，霞柱时透无一郎，音柱宇髄天元，恋柱甘露寺蜜璃，蛇柱伊黑小芭内，水柱富岗义勇，风柱不死川实弥，虫柱蝴蝶忍九人，这九个角色在原著漫画中也是人气非常高的角色，而下一篇章将会讲述这九人的故事。
