故事发生在一处温馨但偏僻的田园小镇奥木染,双亲过世的少年春日野悠(桥本隆 配音)带着体弱多病的妹妹春日野穹(田口宏子 配音)千里迢迢的来到了这里,准备寄宿在祖父留下的房子中。虽然照顾妹妹的起居很辛苦,但悠还是拥有了一段难得愉快的时光。在这里,悠遇见了幼年的玩伴天女目瑛(阪田佳代 配音),成熟温柔的姐姐依媛奈绪(猪口有佳 配音),认真可爱的大小姐渚一叶(小野凉子 配音)等热情亲切的朋友们,还有同班损友中里亮平(中国卓郎 配音)的插科打诨让他笑口常开。同时,一些模糊的回忆逐渐的浮上了心头,是和谁有过怎样的约定呢?面对着面前似曾相识的风景,悠的记忆开始苏醒。
遥远未来,世界人口数在迎来巅峰后,开始呈现下降的趋势。人类为了让物种繁荣存续,制作出管理生态系的AI,并执行「人类多样化实验」。常人、兽人、魔族等经过遗传因子改造诞生的「多样人种」,在环绕高壁的生活圈之中,打造出被称作「CLUSTA」的「多样城镇」。有着丰富人口的「CLUSTA」,在各地都有不同的文化发展以及适合在地生活的人类居住。 为了不面临灭绝,人们都在AI的管理下度日──。