娜美偶然得到一张珍兽岛的地图，据说那里埋藏着无价的宝藏，草帽海贼团的诸位不顾乔巴的阻拦，决定向这座小岛挺进。正在此时，海底火山爆发，将黄金梅利号抛向空中。机缘巧合，他们竟然被抛到了珍兽岛。这个小岛由会说人话的动物统治，它们的老国王麒麟狮已经仙逝，偶然跌落于此的乔巴被众兽奉为新的国王。乔巴拗不过众兽，权且任职。正当珍兽岛为新国王的诞生欢欣鼓舞之时，贪婪邪恶的巴特拉伯爵及其爪牙登陆小岛。为了传说中的“国王宝藏”，他不惜对岛上的动物大开杀戒。他们也势必和草帽海贼团发生冲突…… 本片根据日本漫画家尾田荣一郎的同名原著改编，是2002年上映的第三部动画剧场版。
故事发生在戈加海的海底，在这里，居住着人鱼公主爱丽儿，爱丽儿是管理这片海域的统治者，虽然看遍了蕴藏在海底的各种宝藏，但有一样东西是爱丽儿没有看过的，那就是友谊树的果实。传说中，友谊树每隔千年才会结出一颗果实，不仅如此，通往友谊树的道路充满了艰难险阻，平常人绝对不可能抵达，所以，至今都没有人真正见过友谊树的果实长什么样。 塞拉是一名普通的人类女孩，她的母亲身患重病，于是，她通过一面神秘的墨镜来到了海底王国，在这里，塞拉遇见了爱丽儿，还和寻找时光宝石的辛西娅成为了好朋友，一行人踏上了旅途，他们的目的地只有一个，那就是友谊树所在的地方。
