ゾイドとは、銀河の彼方に生息する、戦う意思を持った金属生命体である。 惑星が最後を迎え、人類は第二の故郷として地球を目指すが、ゾイド因子の暴走と不慮のタイムワープで、突如、21世紀の地球にゾイドが出現。ゾイドによる破壊と度重なる地殻変動で地球は一度滅びた。 レオは自ら発掘したビーストライガーを相棒に、地球の未来を左右する少女サリーと冒険の旅に出発した。
阴云密布的本能町，在神秘恐怖的本能字学园，高高在上的学生会长鬼龙院皋月（柚木凉香 配音）只手遮天，她通过“极制服”统领校内的学生，极制服由所佩戴的星星数量分级，级别越高拥有的战斗力就越强。这一天，一个背着单片太刀剪的女孩出现在本能字学园门口。她叫缠流子（小清水亚美 配音 ），为了调查杀害父亲的真正凶手而来到这个凶险的所在。谁知她刚刚到来不久，便遭到蟇郡苛（稻田彻 配音）、猿投山渦（桧山修之 配音）等学生会四天王的阻击。 关键时刻，缠流子意外得到父亲制作的黑色神衣，由此战斗力大增。连番激烈的战斗在本能字学园展开……
从不起眼的底层探索者迈向成功之路！ 能力值低到堪称路人角色的高中生‧高木海斗是个平凡无奇的探索者，每天都在日本出现的迷宫中狩猎史莱姆，努力赚取零用钱的同时，也暗恋着身为班上女神的童年玩伴。有一天，在他面前出现了一只从未见过的金色史莱姆。海斗在困惑之余击败它后，居然得到了能召唤出神话级存在的从者卡片，此乃价值数亿的超稀有道具!! 当他下定决心进行召唤之后，一名美得超乎人类想象的女武神就此现身── 从路人探索者蜕变成大人物吧！现代奇幻战斗故事开幕！
