随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代—— 村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！ 慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？ 在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……。
被撤职的锦衣卫袁小棠与青梅竹马的方雨亭为寻找父亲失踪的线索潜入鬼街、在朋友石尧山等人的帮助下，一路逛鬼街、破机关、遇各路神秘人物……乱斗与阴谋轮番上演，随着旧事的重提，一切谜团都渐渐有了答案。
故事发生在白玉中学之中，懒懒散散的三岛木洋（松本忍 配音）是软网社的顾问，虽然表面看来其貌不扬，但实际上，他曾经是获得过全国冠军的天才击球手。伊丽莎白（矢作纱友里 配音）是来自英国的留学生，曾因为三岛的影响而选择走上了网球的道路，如今，她作为留学生追随三岛来到了白玉中学。 活泼开朗的春风明日菜（伊藤加奈惠 配音）、对运动有着满腔热血的泽夏琴音（喜多村英梨 配音）、柔情似水温文尔雅的秋山千岁（伊藤静 配音）、拥有健康肤色沉默寡言的冬川来栖（明坂聪美 配音），在这些可爱社员的围绕下，三岛的日常就此拉开了序幕。
