1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
崇祯三年，袁崇焕（陈伟 饰）被凌迟处死于北京，袁家满门遭锦衣卫抄斩，唯袁崇焕8岁的儿子袁承志被袁旧部孙仲寿（苏茂 饰）等救出。多年后，袁承志（窦智孔 饰）华山学艺，深得武功秘笈加持，他通过太白双英的线索，抓到了满清奸细洪胜海（周晓滨 饰），并将其收于麾下。袁承志与众匪与押运漕银的官兵欲血搏杀，被其相救的阿九（孙菲菲 饰）对他心生爱意。袁承志率人潜入盛京，安排洪胜海多方打探官府与市井详情，刺探满清计划。闯王大军入城，天下大事初定，袁承志只身入宫行刺崇祯（高虎 饰），不料崇祯已化装逃走。周皇后上吊身亡，几天后，崇桢在景山自取黄泉路。闯王的腐败令袁承志大失所望，万念惧灰的他跪倒在父亲的坟前......
女警长吕霏侠（周丽淇 饰）已过而立之年，她内心柔情外表刚毅，在爱情的道路上走的跌宕起伏。由于自小受笫一代女警、母亲毕玲珑（卢婉茵 饰）的影响，加之同班死党米家宝（朱慧敏 饰）、金瑞娜（王君馨 饰）都从警，她很热爱自己神秘又刺激的职业。自视恋爱经验丰富的霏侠刚碰上一个大挫折，即将与其结婚的男友董兆良（王浩信 饰）竟然是名在案的大毒枭，这让霏侠大跌眼镜。《响报》记者蓝一一（谢天华 饰）借此大为吵作，霏侠与他产生了过节，祸不单行，这边与蓝一一结下梁子，那边与上司司徒骄（黄智雯 饰）又发生了冲突......
婚前，王可可和黎小俊两家共同为小两口买房，却因各种原因，黎小俊只在合同上写了自己一个人的名字，王可可浑然不知。婚礼当天王可可气愤黎小俊隐瞒事实，黎小俊解释未果，王可可逃婚离开。相爱彼此的两人静下心来后，互相检讨自己的过失，两人牵手言和。黎母对王可可提出尽快生孩子的要求，王可可为逃避家庭琐事，决定找份高薪工作以表能力。王可可巧遇黎小俊的老板程大成成为他的助理，小两口成了同事。因王可可工作出色，又成了黎小俊的上级，两人经常把工作中的喜忧带进了婚姻，产生了一些误会矛盾，但两人相爱的心却没有因为任何外界的力量分开过。历经波折，王可可和黎小俊决定补办一次完美的婚礼。
阀门厂老板周成龙被人发现死在上村路一幢住宅内。死者的弟弟在案发后嫌疑重大。副队长诸葛智在案情调查中发现，死者刚离异的妻子周丽芳竟是自己的初恋女友，没想到婚后大款丈夫并没有给她带来幸福。诸葛智认为此案情杀、仇杀的可能性极大，而队长陈海涛认为死者弟弟背后的那帮赌徒不仅有作案动机，也具备作案条件。两种说法各执一词。经过两个多月的艰苦侦查，扑朔迷离的案情终于大白于天下。
九环集团董事长洪飞（陶泽如饰）在吴州市一手遮天，为所欲为，以洪飞为中心的黑网遍布吴州，资金问题使他铤而走险，制造了巨大财务黑幕…… 洪飞的老同学郭岚（王姬饰）、丁一鸣（佟凡饰）联合创建美亚集团，在郭岚超前设计理念的指引和管理下，美亚日益壮大，并与九环集团一起竞标金牛湖开发区规划设计。为了填补黑洞，洪飞志在必得，遂施黑手，欲置郭岚于死地……几经生死的郭岚决定从郝勇（董小明饰）着手，打入洪飞内部寻找黑幕证据…… 为了挽救美亚，设计师孟晗（刘洋饰）伙同陈小克（吴庆哲饰）作最后一搏；当副市长马龙（樊志起饰）得知私生女就在美亚时，他竟然碰到了昔日老情人…… 洪飞获悉新加坡常氏集团有意与美亚合作时，面对到口的肥肉，洪飞大为恼火……，常氏被迫退出；形势刻不容缓，郭岚、丁一鸣、小克、孟晗、郝勇他们将如何面对？
再婚同士の夫婦と家族と友人たちのちょっと素敵なやりとりを描いた物語。
