在风之街“风都”，左翔太郎、拍档菲利普以及所长鸣海亚树子三人经营着侦探事务所。看似一片和平的风都背后，神秘组织在地下流通着能让普通人变成Dopant的“恶之盖亚存储条”。而造成众多离奇事件的神秘组织核心“园咲家”的每个人，都在风都有着很大的影响力。挑战Dopant们引发离奇事件的翔太郎和菲利普两人，使用六根“盖亚存储条”合体变身成假面骑士W，决然地对抗着园咲家族。 园咲家族的目的到底是什么？假面骑士W、菲利普神秘的过去又是什么？隐含着众多谜题，假面骑士W的战斗拉开帷幕……
霧の総旗艦・ヤマトを目指していたイ401の艦長・千早群像は、父、翔像の生存を知ると、父との再会という新たな目的を抱き北極海へと向かう。一方、メンタルモデルとして成長してきたイオナは、自らの出自を告げられたことでその過去に苦しめられてしまう。
16岁的这一年，林宁即将迎来自己的再一次转学，随风而行的叶，没有决定方向的自由，风景辗转成歌，我却只是个过客。永远陌生的城市，永远陌生的学校，永远陌生的人。渐渐地，在无法摆脱的孤独中陷入疲惫和麻木，甚至找不到挣扎的理由，直到遇见了他，我开始相信，世间总会有那么一个人，与我而言，是光的存在。那些不可言说的心事，那些稚嫩美好的悸动，想要靠近光的奢望一点点萌芽，让我愿意丢掉枷锁，我们算是朋友吗？挣脱风的挟裹，我不想再转学了，然后走向你，我喜欢你，从看见你的第一眼起……
为了阻止原始兽得到行星盖亚上的神秘能源——阿古莫亚。巨无霸在白狮擎天柱的率领下，与威震天率领的机械军团展开了战斗。
