在风之街“风都”，左翔太郎、拍档菲利普以及所长鸣海亚树子三人经营着侦探事务所。看似一片和平的风都背后，神秘组织在地下流通着能让普通人变成Dopant的“恶之盖亚存储条”。而造成众多离奇事件的神秘组织核心“园咲家”的每个人，都在风都有着很大的影响力。挑战Dopant们引发离奇事件的翔太郎和菲利普两人，使用六根“盖亚存储条”合体变身成假面骑士W，决然地对抗着园咲家族。 园咲家族的目的到底是什么？假面骑士W、菲利普神秘的过去又是什么？隐含着众多谜题，假面骑士W的战斗拉开帷幕……
一名因兴趣开始当英雄的男子埼玉。 经过三年苦练，他获得了无敌的力量，能一拳击败任何敌人。 偶然收下弟子杰诺斯后，两人一同加入职业英雄组织英雄协会，每日展开活动。 某日，自称怪人协会的怪人突然出现，掳走了协会干部的子女作为人质。 英雄协会召集S级英雄，策划潜入怪人协会基地的救援行动。 而在英雄与怪人激战正酣时，被掳至怪人基地的人类怪人饿狼，缓缓睁开了双眼！
近未来的东京，谜之组织Demon Seed利用强化服来犯罪。警察对Demon Seed特殊工作课（简称：特工课）屡次出击失利后，现在正面临着存亡的危机。课长服部为了让特工课起死回生而举办了对Demon Seed作战的英雄偶像甄选会，最终由14岁的怪力少女南风麻伦胜出。此后，麻伦开始一面对抗Demon Seed，一面为成为超级偶像而奔走。
