艾拉小镇是一个人与精灵共存的时尚小镇，可可和她的小伙伴们生活在这里，她在这里经营着一家名为LALALACOCO的时尚商店。偶然一天，刚搬来艾拉小镇的小女孩露莉，经过可可的商店，被里面漂亮的服饰吸引进去，原本不善打扮，性格害羞的露莉逐渐认识了可可和可可身边的朋友们，在他们的指点和交流下，原本封闭的心也逐渐敞开，变得越来越有自信。
沉淀了历史浓厚气息的京都伏见，生活着一个有些鲁莽但十分单纯的女孩伏见稻荷（大空直美 配音）。她从小在供奉着狐仙的稻禾神社玩耍，对这里有着深深的羁绊。稻荷偷偷喜欢同班的帅气男孩丹波桥红司（冈本宽志 配音），无奈对方似乎只对美丽的墨染朱美（野水伊织 配音）感兴趣。因意外惹恼丹波桥的稻荷闷闷不乐，此前她偶然救助过一只小狐狸，因此得以觐见神社的狐仙宇迦之御魂神（桑岛法子 配音）。 在神的帮助下，稻荷拥有了变身的能力，可以自由变化成任何实际存在的人。加上小狐狸空从旁相助，女孩的青春发生了变化……
某年的圣诞夜，大批民众聚集到某栋大厦门外，抗议国家与库赞共和国的纯净水合作计划。与此同时，交通网络以及相关电子系统遭到入侵而全面失灵，随后更有维持治安的警察掏枪射击抗议民众。值此危急时刻，公安九课少校的草薙素子（坂本真绫 配音）率领队员巴特（松田健一郎 配音）、陀古萨（新垣樽助 配音）等人迅速展开行动，与恐怖分子和黑客展开连番恶斗。这支个性满满且身怀绝技的机动部队，还要追溯到2027年6月的某天。时任陆军机密部队501机关中佐的真室在街头被人杀害，公安9课课长荒卷大辅（塾一久 配音）在墓地与生化人草薙素子首次邂逅。后者接受荒卷的委托追查真相，在这一过程中和巴特等人邂逅。这正是一段传奇部队“攻壳机动队”成立前夕的故事…… 本片根据士郎正宗的原作改编。
