故事发生在绿山墙农庄之中，马修和玛丽拉是一对相依为命的兄妹，同时也是农场的主人。随着年岁的增长，每日繁重的农活渐渐令两人力不从心，于是他们决定从孤儿院领养一个男孩来作为他们的继承人。 然而，孤儿院却在阴差阳错之下将一个名为安妮（小山茉美 配音）的女孩送到了农场，这个女孩有着满脸的雀斑和一头耀眼的红发，非常的夺人眼球。马修是一个沉默寡言的男人，当性格开朗活泼的小安妮走进他的生活后，他渐渐的被快乐所感染。虽然马修很少和安妮讲话，但是他的关心和爱护如同春雨一般润物细无声，默默守护着安妮的成长。
遥远的，遥远的，时空的彼方。 宇宙里有一群自称为“黄金一族”的人。 创造星群、拥有预知未来能力的他们，向其他还没有成熟的种族发出了呼唤：“启程吧！从自己的母星，到宇宙去……”。 三个种族回应了他们的呼唤。 黄金族把他们分别称为：白银族、青铜族、英雄族。 当黄金族决定离开这个宇宙，到另一个宇宙去时，出现了新的回应者——靠着自己的力量冲出宇宙的第四种族——人类。 黄金族把他们称为“黑铁族”。
人类最大的危机，大崩坏十年后的世界。 舞台是象征复兴的巨大学园都市アカデミア。 虽然学生的生活非常快乐，可是却无法改变，也不能改变自己。 一个空虚的度过每一天的女子高中生「白鸟空（しらとりくう）」。 她不时会梦见相同的“梦”。 来迎接自己的王子的“梦”…… 学园中的学生们都满腔热情地期待着学园祭。 在她的面前，“梦”见了好几次的王子出现了。 这次不是梦，而是现实。 自称是「绫小路（あやのこうじ）京四郎」的他在天空中说着和梦里相同的话。 「一起…走吧」 两人的相遇到底有什么样的意义？ 「神无月的巫女」「圆盘皇女」的原作者创作的新故事！ 豪华场面学园浪漫巨篇！！
King Sombra曾经统治小马国边缘的水晶王国，带来了无尽的苦难。后来他被塞拉斯迪亚公主和露娜公主联合击败，变成阴影，并被放逐。 一千年后，King Sombra卷土重来，想要重新统治水晶王国。大公主希望暮光闪闪一行去保护水晶王国，免受King Sombra的再度袭击。他们克服重重困难和阻挠，去保护水晶王国，并让那里再度恢复生机。
