故事发生在绿山墙农庄之中，马修和玛丽拉是一对相依为命的兄妹，同时也是农场的主人。随着年岁的增长，每日繁重的农活渐渐令两人力不从心，于是他们决定从孤儿院领养一个男孩来作为他们的继承人。 然而，孤儿院却在阴差阳错之下将一个名为安妮（小山茉美 配音）的女孩送到了农场，这个女孩有着满脸的雀斑和一头耀眼的红发，非常的夺人眼球。马修是一个沉默寡言的男人，当性格开朗活泼的小安妮走进他的生活后，他渐渐的被快乐所感染。虽然马修很少和安妮讲话，但是他的关心和爱护如同春雨一般润物细无声，默默守护着安妮的成长。
三年之约后，萧炎终于在迦南学院见到了薰儿，此后他广交挚友并成立磐门；为继续提升实力以三上云岚宗为父复仇，他以身犯险深入天焚炼气塔吞噬陨落心炎……
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
15世纪的欧洲某国。在跳级中被允许进入大学的神童拉法尔。他回应了周围的期待，宣布将专攻当时最重要的神学。但是，从以前开始就热心投入的对天文的热情一直没有被抛弃。 有一天，他遇到了一位名叫休伯特的神秘学者。因为触犯了基于异端思想的禁忌而受到拷问，被关进监狱的休伯特。 他研究的是关于宇宙的冲击性的“某个假说”——。
秋津政之助（浪川大辅 配音）容易害羞的懦弱性格让他在生活上吃了不少的苦头，因此而丢失的工作更是不计其数。一日，刚刚被解雇的阿政遇见了一神秘男子。男子自称弥一（樱井孝宏 配音），想雇佣阿政担任个人保镖的职务，无所事事的阿政当即答应。没想到这次偶遇竟将阿政卷入了一宗绑架案件中去，而弥一正是江湖大名鼎鼎的犯罪团伙“五叶”的首领。会有怎样的遭遇等待着无辜的阿政呢？ 迫于生计，阿政成为了五叶的一份子。在五叶中，谜一样的弥一，美丽妖艳的阿竹（大浦冬华 配音），刀子嘴豆腐心的梅造（高冢正也 配音），沉默寡言的松吉（内田夕夜 配音），在和他们相处的过程中，阿政发现了这些身份扑朔迷离，个性亦正亦邪的浪人们不为人知的另一面。
