由于过去的心理阴影而变成家里蹲的高中生·贯井响，私下有着使用歌唱软件制作歌曲，并投稿到视频网站的兴趣。给这样的他寄来“想要见面交谈”的邮件的，是小学五年级的少女们。自幼就如同姐妹一般一起长大的三人所提出的请求，是为了对照顾过自己的人们表达感谢，在她们曾度过的回忆之地成功地举办演唱会……。
鸣海孝之（谷山纪章 配音）、平慎二（青木城 配音）和速濑水月（石桥朋子 配音）是学生时代的好友，毕业在即，三人亦即将奔向不同的未来。某日，鸣海孝之结识了名叫凉宫遥（栗林美奈实 配音）的少女，在速濑水月的牵线搭桥下，鸣海孝之和凉宫遥走到了一起。 其实，水月一直暗暗的喜欢着孝之，在生日当天，她找到了正准备和凉宫遥约会的孝之，希望他能够送自己一枚戒指作为礼物。然而，当孝之告别水月来到约会地点时，等待着他的却是凉宫遥因车祸而陷入昏迷的噩耗。三年之后，凉宫遥从昏迷中苏醒了，可是她的记忆依旧停留在三年前出事的那一天，殊不知此时的孝之和水月早已经走到了一起。
印有“东都塔”图案的新版一万日元纸币正式发行，一时间引发社会热议。柯南与少年侦探团、阿笠博士、小兰、园子一同前往日本纸币印刷局长野工厂参观。 与此同时，警视厅召集了黑田管理官、目暮、佐藤、高木等搜查一课警员，以及风见裕也等公安部人员。 文书鉴定技官里见透子判定，佐藤与高木侦办的杀人案中查获的新版一万日元纸币为假钞，警方随即成立搜查本部。 由于这是日本境内发现的第30种伪造纸币，本案被通称为“30号事件”，这批假钞也被命名为“Ultra 30”。 新版纸币出现假钞流通——这一史无前例的消息曝光后引发全社会混乱，柯南与平次动身前往疑似印制这批假钞的大阪工厂—— 另一边，调查触角也延伸至大阪以外的其他纸币工厂。 静冈与神奈川县交界处的纸币工厂，由静冈县警横沟参悟、神奈川县警横沟重悟负责；而小兰等人所在的长野与群马县交界的纸币工厂，则集结了长野县警大和敢助、诸伏高明、上原由衣，以及群马县警山村操。 面对这场由新版纸币伪造案引发的国家危机，柯南史上最大规模全明星阵容，全力迎战！
统率着作为邪恶化身的魔族，以暴力与权力不断侵略世界的魔王阿里曼。然而，这位魔王不知为何突然停止了所有的侵略行为！魔界最强的魔王停止侵略的理由……竟然是——魔王家的女儿瞳也太温柔了吧！！ 虽为魔族之身，瞳的温柔却深不见底。这份温柔之强大，就连凶残的魔族、暴戾的魔物、被奴役的人类，乃至势不两立的天使，都能被治愈得心都化开。女儿这副模样，让魔王担心得不得了，哪还有心思去侵略啊。看到魔王苦恼的模样，近臣贾希决心要将瞳培养成出色的魔族，于是开始对她进行各种试炼。然而贾希尚未察觉，这些试炼反而会让瞳的温柔之心愈发闪耀……而瞳的这份温柔，正在这个毫不温柔的世界里激起阵阵涟漪——
巨无霸们押送威震天返回塞博特恩时，威震天逃脱，率先抵达塞博特恩，并完全控制了塞博特恩，击落了巨无霸们的飞船。威震天企图消灭全部有机形态元素，在塞博特恩上撒播病毒，抽取了所有变形金刚的火种，以将其纯化为无机化力量。擎天圣率领小分队顽强抵抗，在圣贤的指引下，激发了塞博特恩内部的有机能源，对抗威震天的机械兵军团（武装兽）。最后，威震天成功收集所有变形金刚的火种并纯化自己，变得异常强大，企图利用魔力神球之钥将塞博坦完全无机化，擎天圣为阻止威震天而与其同归于尽。塞博坦转变为充满绿色的有机星球，擎天圣用生命换来了塞博坦有机与无机的和谐统一。
