由于过去的心理阴影而变成家里蹲的高中生·贯井响，私下有着使用歌唱软件制作歌曲，并投稿到视频网站的兴趣。给这样的他寄来“想要见面交谈”的邮件的，是小学五年级的少女们。自幼就如同姐妹一般一起长大的三人所提出的请求，是为了对照顾过自己的人们表达感谢，在她们曾度过的回忆之地成功地举办演唱会……。
2033年，人类阻挡小行星撞击地球的计划失败了，人类灭亡了，而被遗忘在月球上的中等动物研究员独孤月幸运的活了下来，成为全宇宙最后一个人类。但这并不值得高兴，虽然月球基地物资充沛，除此之外，陪伴他的只有无尽的孤独。他开始锻炼身体、探索基地、创作漫画，不知不觉竟然将自己在月球上的孤独生活过出了乐趣。然而他不知道的是，基地摄像机将他的视频画面传回了地球，全球的幸存人类在地球上直播观看他的月球生活，并将他视为榜样。直到有一天，他发现自己没动过的蛋糕上有一个牙印.....难道月球上还有什么别的存在？
带着容易引起灾难的危险秘宝“魔剑目录”，居无定所的流浪剑士，殇不患。从祖国西幽离开辗转来到了东离之地后，好不容易获得了一时安宁的他，不料被仇敌“祸世螟蝗”得知这个消息，再次陷入危机之中。从遥远的西幽不断接揰而来的异能、异形的刺客们。就在殇不患面对这样的困境之中，身穿红莲之衣谜一般的吟游诗人就此现身。
月落和亚晨是一对双胞胎兄妹，他们在一个与世隔绝的深山小村落里出生，被称为“分隔夜与昼的双子”。他们拥有获得特殊力量的资格，一场围绕他们的双使战斗也随之展开。 双使是一种成对的存在，被人类冠以“幽灵”、“怪物”、“怪兽”或“异形”等各种各样的称呼。它们并非人人可见，各自拥有不同的外表、性格和能力。每对双使都有一个与之缔结契约的主子，而指挥它们的主子被称为“双使师”。 许多大人在双胞兄妹开始懂事前就暗中操纵，试图夺取他们的力量，因此月落和亚晨在年幼时就被迫分离。本作故事以兄妹俩的重逢展开序幕。
从小，安琪莉可（远藤绫 配音）的梦想就是能够成为一名医生，给需要帮助的患者带来健康和希望，即便是父母被魔兽袭击身亡也没能够改变安琪莉可坚定的决心。一次偶然中，在医院工作的安琪莉可发现自己拥有能够净化魔物的神奇能力，在周遭同伴的鼓励和支持下，她毅然决然的加入了名为Aube Hunte的组织，踏上了一条充满了危险和争斗的道路。 在净化魔物的旅途中，安琪莉可结识了直率坦诚的雷因（高桥广树 配音），稳重可靠的尼克斯（大川透 配音），温柔善良的杰德（小野坂昌也 配音），忠心耿耿的修迦（小野大辅 配音）等人，在他们的帮助和保护下，安琪莉可逐渐成长成为了可以完全消灭魔物的女王。
