高中生八坂真寻,在某天晚上突然被怪物袭击,此时出现搭救他的,就是自称克鲁苏神话中外神之一的银发美少女奈亚拉托提普(昵称奈亚子)。 身为宇宙人的她是神话中可以自由变化外表的"无貌之神",由于其它的宇宙人正准备攻击真寻,所以才会被派遣到地球来保护他,之后便展开了同居生活。
故事发生在洋溢着青春气息的神奈川高中内，祇园健次（千叶翔也 配音）是刚刚进入这所学校就读的高一新生，在阴差阳错之下，他结识了名为石清水澄明（安达勇人 配音）的男生。石清水澄明虽然拥有高大壮硕的身材，性格却格外的懦弱胆小，刚进学校没多久就遭到了高年级同学的霸凌，健次身材娇小，但脾气却很爆，多亏了有他的帮助，石清水澄明才勉强脱身，健次也因此得到了加入橄榄球社团的契机，成为了一名橄榄球预备队员。 在球队里，健次结识了很多志同道合的伙伴，最为年长德高望重的赤山濯也（细谷佳正 配音）、整天笑嘻嘻的好好先生八王子睦（逢坂良太 配音）以及拥有丰富的比赛经验，性格十分傲慢的大原野越吾（小野贤章 配音）。
高中三年级的筒井光是所谓的御宅族少年。 只要有游戏或动画里的二次元女生的话，感觉就能独自一人生活了……。 但，他突然被超绝3D（现实）美少女·五十岚色叶告白，并开始和她交往！ 在被奔放的色叶玩弄于股掌之间的同时，筒井逐渐爱上了她……。
2008年——神秘势力的出现，
动漫、游戏、漫画、音乐、铁路、cosplay等所有御宅文化都被排除的日本。
周边被收容，宅男被以保护的名义镇压，
人们仿佛失去了自我，毫无疑问。
被负责维持秩序的组织“SSC”蹂躏，宅男以为已经灭亡了——
但是，夺回被封锁的秋叶原后，出现了揭竿而起的人。
年轻的革命者“御宅英雄”——比什么都热爱御宅文化，比谁都热爱秋叶的男人。
还有仰慕他的3个魔法少女——“无政府”、“蓝”、“粉”。
以2011年的日本为舞台，聚集在自由之旗下的宅男们——
秋叶革命军，挑战SSC首领“SHOBON”的壮烈的战斗。
为了这个可以破坏混沌和秩序，尽情地喜欢自己喜欢的东西的世界。
聚集在自由旗帜下的宅男们啊。
夺回被剥夺的文化
掀起OTAKU COUNTER CULTURE !
猫眼三姐妹是专门窃取美术作品的盗贼集团，她们作案时总会留下带有猫眼三姐妹字样的卡片。被猫眼三姐妹所盗的美术作品都属于她们失散多年的父亲海因茨（一位著名的艺术收藏家）所拥有。犬鸣警察署刑警内海俊夫负责调查猫眼三姐妹的案子，但是逮捕行动却一次又一次因猫眼三姐妹逍遥法外而失败。来生瞳是内海俊夫的女友，经营一家同样名为“猫眼”的咖啡厅。内海俊夫却不知道，来生瞳即是猫眼三姐妹之一……
睦悟郎是个热爱动物、心地善良的青年，却总是遭遇不幸 公司倒闭、弄丢钱包、连走在路上都会撞到招牌…彷彿全世界的霉运都降临在他身上！某日，睦悟郎巧遇一个占卜师，人生从此由黑白变彩色！ 当睦悟郎回到家里，竟然有三个可爱的美少女迎接他！这三名自称为小兰、小翼与久留美的女孩，其实是悟郎过去饲养的金鱼、鸚鵡和黄金鼠。牠们在死后为了报恩，以人类的姿态现身，成为悟郎的守护天使，也开始了悟郎另一种苦难日子……
