故事设定在一个身怀魔力的人类濒临灭绝的世界，武力的最高境界从使用利剑，转而到使用魔法，继而变成了使用枪械。就读于培训用以取缔残存魔力威胁的“异端审问官”专业机关——“对魔导学园”的男主角草薙哮，是个完全不会使用枪械，只靠一柄刀与敌人交锋的另类。而他率领的第35试验小队又被称为“杂鱼小队”，顾名思义是由一群劣等生拼凑而成的团队。某一天，拥有“魔女猎人”资格的超精英持枪高手凤樱花，竟然加入了这支队伍。在带领队员动身执行回收魔导遗产的任务中，一场学园动作奇幻大作就此开始。
热爱棒球的美丽少女川岛南（日笠陽子 配音）是东京都立程久保高中的二年级学生，她自小学时代的好朋友宫田夕纪（花澤香菜 配音）则担任该校棒球部的经理。可惜程高棒球部是一支万年垫底队伍，他们往往在第一轮就被淘汰，“进军甲子园”更是想都不敢想的事情。加上教练指挥不力、队员沟通不畅、训练消极怠工，程高棒球部破罐破摔。适值此时，夕纪因病住院，为了免去好友的忧虑，小南自告奋勇接替经理人的职务。在被球队事务搅得心烦意乱的时候，她得到了管理学大师彼得·杜拉克的名著《管理学：任务，责任，实践》。凭借这本书，小南带领着万年垫底队向着甲子园奋勇前进…… 本片根据岩崎夏海的同名管理学原著改编。
