地球附近的一个异空间中有一个酷宝王国，酷宝以人类情绪波动时散发的情感核能为食物。情感核能分两种，开心、欢乐时产生的情感核被称为七彩元动能，相反悲伤、痛苦产生的是黑色邪动能。女魔头阿酷波斯，率领叛军企图推翻酷宝国王的统治，并通过时光机逃到了20年前的人类世界，企图影响未来人类世界的快乐领袖——司徒乐的成长，让他容易产生邪恶的念头和情感，为阿酷波斯提供庞大的黑色邪动能，征服酷宝王国。酷宝国王得知阿酷波斯的计划，便派小宝前往过去的人类世界保护幼年的司徒乐。
平凡少年韩立出生贫困，为了让家人过上更好的生活，自愿前去七玄门参加入门考核，最终被墨大夫收入门下。 墨大夫一开始对韩立悉心培养、传授医术，让韩立对他非常感激，但随着一同入门的弟子张铁失踪，韩立才发现了墨大夫的真面目。 墨大夫试图夺舍韩立，最终却被韩立反杀。通过墨大夫的遗书韩立得知了一个全新世界：修仙界的存在。 在帮助七玄门抵御外敌之后，韩立离开了七玄门，前去墨大夫的家中寻找暖阳宝玉解毒，并帮助墨家人打败了敌人。 通过墨大夫之女墨彩环的口中得知太南小会地址，韩立为追寻修仙人的足迹决定前往太南小会，拜别家人后……
卑微家奴方寒从小抱着“宁做乞丐，不为人奴”的信念，凭借一己之力纵横天地之间。他靠着一股不服输的倔强突破神通的奥秘，将肉身锻成永生之躯。努力一步步踏入仙道，最终成为巅峰王者。
近未来的东京，谜之组织Demon Seed利用强化服来犯罪。警察对Demon Seed特殊工作课（简称：特工课）屡次出击失利后，现在正面临着存亡的危机。课长服部为了让特工课起死回生而举办了对Demon Seed作战的英雄偶像甄选会，最终由14岁的怪力少女南风麻伦胜出。此后，麻伦开始一面对抗Demon Seed，一面为成为超级偶像而奔走。
烈子在分手后用VR男友填补空虚的心灵，并在游戏中大肆挥霍。为了还债，烈子不得不在一支地下偶像团体兼职打工。而她的怒火也再度燃起。
故事以一連串女高中生離奇死亡的事件開始，深陽學園2年C組的女學生宮下藤花原來隱藏著「Boogiepop Phantom」的第二重人格，行為奇異，究竟宮下是否這些死亡事件的主谋？ 「Boogiepop Phantom」到底是都市中傳說的死神，還是正義的使者？
