2022年，一场未来战争在少数人类幸存者和无穷无尽的机器大军之间激烈进行了数十年。1997年，被称为“天网”的人工智能获得了自我意识，并向人类开战。 一名被送往过去改变人类命运的士兵被夹在未来和过去之间。她来到1997年，任务是保护一位名叫马尔科姆·李的科学家。这位科学家致力于推出一种新的人工智能系统，以对抗“天网”即将对人类发出的攻击。马尔科姆一面应对其发明所涉及的复杂的道德问题，一面遭到来自未来的无情杀手的追杀，而这永远改变了他三个孩子的命运。
故事发生在戈加海的海底，在这里，居住着人鱼公主爱丽儿，爱丽儿是管理这片海域的统治者，虽然看遍了蕴藏在海底的各种宝藏，但有一样东西是爱丽儿没有看过的，那就是友谊树的果实。传说中，友谊树每隔千年才会结出一颗果实，不仅如此，通往友谊树的道路充满了艰难险阻，平常人绝对不可能抵达，所以，至今都没有人真正见过友谊树的果实长什么样。 塞拉是一名普通的人类女孩，她的母亲身患重病，于是，她通过一面神秘的墨镜来到了海底王国，在这里，塞拉遇见了爱丽儿，还和寻找时光宝石的辛西娅成为了好朋友，一行人踏上了旅途，他们的目的地只有一个，那就是友谊树所在的地方。
在一次机缘巧合之下，和妹妹天奈（三泽纱千香 配音） 相依为命的杰（铃木达央 配音）穿越到了100年后的世界，杰震惊的发现，100后的他们曾经的宅邸，变成了一所学校。就这样，杰隐姓埋名改名为神宫司高马，开始在学校中一边学习，一边寻找回到过去世界的方法。 在学校里，杰很快就结识了一帮好友。以自我为中心，谁也不放在眼里的大少爷藤代悠希（KENN 配音）、拥有可爱外表，并常常利用自己的可爱来操纵他人的青叶萤（永冢拓马 配音）、智商和人气都很高，但始终不会以真心待人的绯樱春人（丰永利行 配音）、拥有着和福尔摩斯一样的好奇心的茶野京一（小林千晃 配音）。
