2008年4月からは第3シリーズである『全国大会篇 Final』が全4巻で発売された。 Vol.0： [0. 焼肉の王子様] Vol.1： [1. 頂上対決! ]、 [ 2. オレたちのやりかた] Vol.2： [3. 真昼に星は見えるか!? ]、 [4. 心をひとつに] Vol.3： [5. 最終決戦! 王子様VS神の子 ]、 [6. Dear Prince〜テニスの王子様達へ〜]
BotBots are Transformer robots that disguise themselves as everyday mall objects. By day, these BotBots hide quietly on store shelves. But, at night, they jump into adventure until a group of BotBots called ‘The Lost Bots’ run into the mall security guard and put all the bots in danger. Will these misfits be able to overcome their differences, defeat the security guard and gain acceptance in the eyes of the other bots?
故事发生在一所名叫第3新东京世立NERV学园中，校长是严肃又寡言的碇原度（立木文彦 配音）。作为校长的儿子，碇真嗣（绪方惠美 配音）感到压力很大。于此同时，来自外国的红发转学生明日香（宫村优子 配音），分裂成三个、以姐妹的形式出场的凌波丽（林原惠美 配音）都给碇真嗣的学校生活带来了翻天覆地的变化。此外，在原作中高大帅气的初号机，也将以娇小可爱的形象，作为学院的一份子出现在动画中。 动画以《新世界福音战士》中的角色为原型，一改原作沉重严肃的气氛，描述了轻松愉快的校园生活。制作方首次采用了3D的Q版造型，配以实景背景和2D拼接，造就了多元化的绘画风格。
故事主要讲述了女主角桃园奈奈生因好赌而欠债的父亲不知去向，被讨债的人赶出了家。在走投无路之时，她帮助了一位被狗追的懦怯的男人，得知她的遭遇后神秘的男人说出了「我把我的家转让给你吧。」这样出奇的话……
