在《剧场版物怪：唐伞》的激烈对决后不久，卖药郎（神谷浩史配音）再次现身，这次他来到了大奥的内庭。先前事件过后，这里正经历一场动荡。出身名门的女子大友牡丹（户松遥配音）接替歌山成为新任总管，并开始推行一种严谨而平衡的领导方式。这种高压政策逐渐加剧了她与曾受天皇（入野自由配音）宠幸的资深花魁富贵（日笠阳子配音）之间的关系日益紧张，两人之间的裂痕日益加深。天皇的妻子有希子皇后（种崎敦美配音）所生的皇子即将选定监护人，一场突如其来的事件却彻底颠覆了富贵的命运。她产下了一个被视为“不祥之子”的婴儿，被年长重臣大友（堀内贤雄配音）视为威胁，从而成为一场权谋阴谋的目标。在男权体制编织的权力之网中，利益冲突与掩盖真相的手段迅速失控。与此同时，奇怪的事件接连发生，人们无故自燃，瞬间化为灰烬。卖药郎怀疑是物怪作祟，展开调查。然而，他所面对的，是一种神秘而不断变化的群体性威胁。这个物怪的真实身份，正是火鼠（日根住配音）之子。他们不仅攻击人类，还似乎在寻找自己的母亲，然而，这位“母亲”始终不肯现身。火鼠为何专门针对那些伤害新生儿之人？又是什么样的悲剧，让她悲痛至极、自焚不止？卖药郎深入大奥之中，揭开层层黑暗，追寻斩除物怪所需的三大要素：“形”、“真”与“理”，誓要揭示真相，平息灾祸。
本应由于交通事故（!?）导致人生轻易闭幕的游戏迷家里蹲·佐藤和真，事出偶然地带着女神·阿库娅转生到了异世界。“在如同RPG游戏一样的异世界，享受憧憬已久的冒险者生活！目标是勇者！”像这样兴奋了还没多久，转生而来的和真就尽是遇到倒霉的事情。 麻烦制造机废柴女神·阿库娅，重度中二病魔法使·惠惠，妄想停不下来的女骑士·达克妮丝，和真与空有高超能力值却无比残念的这3人组队，欠下一屁股债，涉嫌颠覆国家罪而遭到审判，讨伐魔王军干部，偶尔还会死一死…… 这样的某一天，突然跑来的红魔族少女·悠悠的一句爆炸性发言，让和真等人当场石化。“我想要和真先生的孩子！”问明原因，原来惠惠和悠悠的故乡“红魔之里” 目前正濒临灭亡的危机。追在出发前去拯救村落的悠悠后面，和真等人向着红魔之里出发，但——！？向和真小队袭来的最大危机！平凡的冒险者和真度过的异世界生活，未来究竟会怎样！？
人类和机械生命体决战后过了1000年，地球逐渐从颓废中恢复了过来，但是兵强马壮的巴西帝国又发动了征服世界的战争。 少女伊可儿偶然遇到了1000年前大战中幸存的机动兵器“夏安”，一人一机开始了冒险之旅……
