故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
Rick（瑞克）和Morty（莫蒂）讲述了地球C-137S1-06之后转移到的时空（可在S2-02Jerry寄托所中Rick填的表格中看到）之前的时空由于Rick的药水使除了Morty一家的人类都变成了柯南伯格式的怪物）的Rick和Morty的冒险故事，但有时也 有Rick和Summer，Morty和Jerry这样的冒险组合。剧情设计和制作手法都极为出彩。
