在人类生活的世界里，存在着另一个完全独立的平行世界纳尤古。纳尤古由拥有魔法的精灵师和精灵组成，他们将人类世界称之为“大方块”。10岁的小学生包小龙，大方块的一名小学生，然而他天生就有点不同，常常把老鼠、蟑螂等动物们看成可爱的小精灵。小龙的异常得不到家人的理解，更被同学和小伙伴们排斥。有一天，一颗粉红色的流星飞进了小龙的眼睛里，他开始听得到小精灵们的心声。精灵们不断涌现，惊呼小龙就是“那个人”黄金龙的精灵师。正当小龙迷惑不解时，他收到来自纳尤古齐格威精灵师学校尤达校长的信。
身患绝症的年轻人李长寿，意外重生在封神大战之前的上古时代，成了一个炼气士。为了修得长生不老且能在残酷的洪荒安身立命，他低调行事，凡事谋而后动，从不轻易步入危险之中，藏底牌，修遁术，炼丹毒，直到有一天，他的师傅突然给他收了个师妹回来，本想低调修行的李长寿被卷入了一场场冒险。不动稳如老狗，一动石破天惊，动后悄声走人，在打败邪恶敌人的同时，结交志同道合的朋友，实现自己的人生价值。
克莱恩（愚者）在灰雾之上召开塔罗会时，聆听到了新的祈求。他将祈求者戴里克从神弃之地白银城拉上灰雾，通过戴里克的讲述了解到了这个神秘城邦白银城的故事。戴里克希望愚者可以帮助自己，拯救白银城，愚者予以了正向回应，并让戴里克从22张塔罗牌中选择自己的那张，戴里克选择了“太阳”作为自己的代号。之后，“倒吊人”阿尔杰提出了自己的交易需求，需要“正义”奥黛丽运用自己的人脉尽可能的在鲁恩国首都贝克兰德收集海盗七将军之一——齐林格斯的信息。并希望能获得愚者的帮助杀了齐林格斯。为此奥黛丽结识了佛尔思、休这二位非凡者，帮助寻找齐林格斯。最终，克莱恩找到自己的老师阿兹克，并借他的力量帮助塔罗会的各位完成了此事。
出生在通灵世家的麻仓叶（佐藤佑子 配音），从小就被爷爷教导成为了一名通灵人。通灵人，即可以和神、精灵乃至往生者自由沟通，且借由这些神灵的能力来治疗或是破坏。这种能力被很多人所渴望拥有。从爷爷那，叶得知如果能从通灵王大赛中脱颖而出并胜出，即能得到精灵王，从而实现自己的任何愿望。一直信奉“船到桥头自然直”的叶也立下了志愿，朝着通灵王之路前进。 为了寻找自己的持有灵，叶转学来到了踏张之丘，认识了小山田万太（犬山犬子 配音），并迅速和他成为了朋友。后又结识了同样志向成为通灵王的木刀之龙（田中正彦 配音）。因一次意外，叶得到了他的持有灵——600年前的武士阿弥陀丸（小西克幸 配音）。因而正式踏上了通力王之路。随后叶的未婚妻恐山安娜（林原惠美 配音）等也悉数登场。通灵王比赛也日渐来临……
动画剧情舞台为2047年，与人类之敌「D2」对抗而荒废的美国。指挥家「朝雏タクト」与「Musicart」的少女「命运」，在失去音乐的世界中各自为了自身的渴望，共同出发前往纽约。
在每一个角落都被探索完毕的世界中，唯一残留的秘境——大洞穴“阿比斯”。 不知道延续到何方，深不见底的巨大纵向洞穴， 栖息着奇妙奇怪的生物们， 沉眠着现在的人类无法制造的贵重遗物。 “阿比斯”那充满了不可思议的姿态吸引了人们，并驱使人们展开冒险。 如此，多次挑战大洞穴的冒险者们， 陆续得到了“探窟家”的名号。 住在建造于阿比斯边缘的城镇“奥斯”的孤儿莉可， 梦想着有朝一日成为母亲那样伟大的探窟家，并解开阿比斯的谜团。 某天，以母亲莱萨的白笛被发现为契机， 莉可决定潜入阿比斯深处。 被莉可捡到的丧失记忆的机器人雷格， 也为了寻找自己的记忆而决定同行。 莉可在深界四层中了穿弹兽的毒。 救了莉可的，是“生骸”娜娜奇。 娜娜奇也成为两人的同伴，三人的冒险向着波多尔多所在的深界五层进发。 在那里，他们遇到了一位自称为普鲁修卡的女孩子……
