神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
少年陈小凡因为误吞混元珠进入异世界，成为“靠脸吃饭”的陈家少爷，暮云城第一美男子。他发现他虽然受暮云城中众女子的追捧和喜爱，却是个无法修炼的废柴。为了回到原来的世界，他放弃了一向安稳的少爷生活，抗着家族的强烈反对，毅然决然地踏上修炼之路。
