2016年日本的首都圈突然出现巨大的茧。从初次确认以来已经过了数月，其正体仍未判明，人们将这正体不明的茧称作Phenomenon。唯一能够明白的是被吸收到Phenomenon内侧的人们会开始发狂并互相残杀。对此感到焦躁的日本政府为了解决突然出现的Phenomenon而组织了特殊部队。总务省情报管理厅管辖扩张现实特殊战略队群特别攻击队——又名扩张少女系三重奏。
恋か、破壊か――。原因不明の病に悩まされている女子高生・赤石黒絵（クロエ）。不器用で人との交流を避けて生きてきた彼女は、とある出会いでクラスのモテ男子・南新汰に恋をする。少女が恋心に気づいたとき、眠っていた力が解放される…。争う恋と理性――。少女漫画の常識を覆す、衝撃の展開が日本を襲う!!
