在《剧场版物怪：唐伞》的激烈对决后不久，卖药郎（神谷浩史配音）再次现身，这次他来到了大奥的内庭。先前事件过后，这里正经历一场动荡。出身名门的女子大友牡丹（户松遥配音）接替歌山成为新任总管，并开始推行一种严谨而平衡的领导方式。这种高压政策逐渐加剧了她与曾受天皇（入野自由配音）宠幸的资深花魁富贵（日笠阳子配音）之间的关系日益紧张，两人之间的裂痕日益加深。天皇的妻子有希子皇后（种崎敦美配音）所生的皇子即将选定监护人，一场突如其来的事件却彻底颠覆了富贵的命运。她产下了一个被视为“不祥之子”的婴儿，被年长重臣大友（堀内贤雄配音）视为威胁，从而成为一场权谋阴谋的目标。在男权体制编织的权力之网中，利益冲突与掩盖真相的手段迅速失控。与此同时，奇怪的事件接连发生，人们无故自燃，瞬间化为灰烬。卖药郎怀疑是物怪作祟，展开调查。然而，他所面对的，是一种神秘而不断变化的群体性威胁。这个物怪的真实身份，正是火鼠（日根住配音）之子。他们不仅攻击人类，还似乎在寻找自己的母亲，然而，这位“母亲”始终不肯现身。火鼠为何专门针对那些伤害新生儿之人？又是什么样的悲剧，让她悲痛至极、自焚不止？卖药郎深入大奥之中，揭开层层黑暗，追寻斩除物怪所需的三大要素：“形”、“真”与“理”，誓要揭示真相，平息灾祸。
十万年前，仙界诛仙混战，众神陨落，一本暗藏玄机的《生死天书》落入人间。青年考古学家陆云在一次科考中无意中闯入一间根本无法辨别年代的墓室，至此平静的生活被打破，开始了寻找各种谜团的惊险历程。 被天书拖入仙界的陆云以琅邪天玄州州牧的身份掌管玄州城，刚来到仙界就遇上第一个难题，陆云任期将至，玄州各大世家对州牧之位虎视眈眈，为了能继续任职，无法修炼的陆云带着自己的女使潜入玄赤山大墓寻找能够改变体质的九窍金丹，为躲避仇家暗算，陆云和女使潜入墓穴深处，主仆两人先后遭遇千年尸怪的追赶，成群的尸蝇，诡异的石灵后意外躲进一个暗香四溢的女子闺房，画像上的女子美若天仙，陆云下意识的触碰，激发出体内生死天书的力量，谁知画像上的女子竟是上届玄州州牧的丹仙煜影，也是天书中记载的第一位轮回使者。 有了丹仙的调养，陆云顺利改变体质，通过与琅邪天帝的谈判暂时保住自己的身份，本以为事情就此告一段落。陆云每晚在梦中总能看见一些不属于自己记忆的片段，一次挽风进入陆云房内，看见沉睡的陆云体内的天书疯狂震动，伴随着周身九龙抬棺之异景。为解开天书之谜，陆云根据书中的提示前往毗邻玄河的玄水城查找真相，此时正值玄河大祭，维持百年的活婴献祭使玄水城早已没了生机，百姓想方设法将幼童藏入暗室，襁褓婴儿更是被放进铺满厚棉花的木箱中，要救孩童，陆云必须潜入玄河一探究竟。 满目疮痍的玄河水宫早已被隐藏在黑暗中的乾达婆怪物霸占，陆运等人还未从触目惊心的怪物群中脱险，又受到已经魔化的玄河河神的攻击，为救同伴卿寒，陆云以浮生图为武器，生生逼出体内操控生死天书的力量收服河神，并且又得到了一门新的技能，至此已经是陆云收服第四位轮回使者，每位轮回使者都分别代表了符道、武道、阵法、炼器的等不同方面的最强。陆云步步逼近天书的真相，即便是与天地为敌，四海为伍，此时坐在九重天之上的咒王看着陆云露出微笑：“哼，不自量力的蝼蚁...”
藤井夏生（八代拓 配音）幼年时失去了母亲，因此对年长的女性充满了憧憬。一次偶然中，夏生在学校的楼顶遇见了英语老师橘阳菜（日笠阳子 配音），阳菜温柔的身影深深的将夏生吸引，令他不自觉的坠入了爱河。然而夏生知道，自己和老师是不可能有结果的，于是，他将郁闷发泄到了联谊活动之中。 在联谊会上，夏生邂逅了名为瑠衣（内田真礼 配音）的女孩，那一天，瑠衣将自己的第一次献给了夏生。之后，夏生的父亲告诉他自己即将再婚，而女方要带她的两个女儿住进夏生的家中。让夏生没有想到的是，这两个姑娘竟然正是阳菜和瑠衣。
作为最底层职业【鉴定士】出生的艾因一直过着最底层的生活。 在一次冒险中，遭遇大量地狱猎犬，同伴为了活命而把艾因当做了诱饵。 本因就这么结束生命的艾因遇到了她，从此艾因的命运发生了巨大的变化。
