故事发生在秀知院学园之中，只有在智商上非常顶尖的少年少女们才能够获得进入这所学园学习的资格，而在学园的学生会中，更是汇聚了就算在这间学园里也能算得上是数一数二的精英们。白银御行（古川慎 配音）是学生会的会长，虽然出生在贫穷的家庭之中，但他凭借着自己的极端努力在学生中脱颖而出。 同样优秀的，还有副会长四宫辉夜（古贺葵 配音），虽然各方面都属拔尖，但她的性格却给人一种冷淡的感觉。实际上，白银和四宫在情感上相互吸引着，只是他们谁都不愿意首先迈出第一步，而是想方设法逼迫对方行动，一转眼半年过去了，两人的关系可谓是毫无进展，这可怎么办呢？
因长期在战争中活跃，而被称为〝救国英雄〞的男人——迪亚斯。 他所收到的唯一奖励就只有——广阔的领地。 与生活在当地的鬼人族少女‧阿尔娜相遇后，开始了他作为领主的第二人生。
月落和亚晨是一对双胞胎兄妹，他们在一个与世隔绝的深山小村落里出生，被称为“分隔夜与昼的双子”。他们拥有获得特殊力量的资格，一场围绕他们的双使战斗也随之展开。 双使是一种成对的存在，被人类冠以“幽灵”、“怪物”、“怪兽”或“异形”等各种各样的称呼。它们并非人人可见，各自拥有不同的外表、性格和能力。每对双使都有一个与之缔结契约的主子，而指挥它们的主子被称为“双使师”。 许多大人在双胞兄妹开始懂事前就暗中操纵，试图夺取他们的力量，因此月落和亚晨在年幼时就被迫分离。本作故事以兄妹俩的重逢展开序幕。
電影版《來自深淵 深魂的黎明》很快將要在 2020 年 1 月 17 日於日本上映，官方特別為支持本作的粉絲製作了觀影特典，是將今年的愚人節企劃《マルルクちゃんの日常》以四個短篇動畫呈現，分為四週在正片之前上映。 以因為皮膚無法照射到陽光，與奧森一同居住在深界二層「監視基地」的「瑪露露庫」作為主角，描繪瑪露露庫日常生活的番外篇。
「想被赤头老师吃掉」被大街小巷中传闻的「抢夺短裙大叔」抢走短裙的大神雏子。拯救她的是，偶然路过的赤头老师。但是，这是雏子为了接近老师而故意让短裙被抢走…「想成为老师心中特别的人…！」锁上门，关掉灯，乘上老师的雏子。被她上下其手的老师，心里在作为教师的立场和纠葛中，慢慢地丧失理性…被可爱又有点色色的大神同学盯上的赤头老师的命运是——！？
