奇猫国遭到妙狗国的占领，小羊们变成猫出发营救，却被敌人出招击落。喜羊羊在妙狗国醒来，发现与同伴分散在了妙狗国的五层区域，历经千辛万苦，喜羊羊找齐伙伴并意外解开封印获得新奇力，谁料这一切都是狗国王的阴谋……
随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代—— 村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！ 慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？ 在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
渐渐习惯了高中生活，曾经的中二病患者暗黑系少年富樫勇太（福山润 配音）无论从外表还是言行来看都已经变成无比正常的男孩了，只是也许命运有意开玩笑，让他的周围充斥着中二病患者或者潜在患者。首当其冲的就是中毒患者小鸟游六花（内田真礼 配音），她无时无刻不在做着各种无厘头且搞笑的事情。学姐五月七日茴香（浅仓幸美 配音）所创立的睡觉部也物以类聚，与小鸟游不遑多让的凸口早苗、外表温柔贤淑但有着强烈黑化欲望的丹生谷森夏（赤崎千夏 配音），可爱的少男少女们交织着校园生活的点点滴滴，上演了一个又一个有趣的小故事…… 本片根据虎虎的漫画原著改编。
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
