年幼的爱力克兄弟十分思念去世的母亲，不惜触犯炼金术中最大的禁忌，进行了人体炼成。可是炼成失败了，哥哥爱德华失去了左腿与右臂，弟弟阿尔冯斯失去了肉体，只能把灵魂附身在一副铠甲上。为了偿还他们自己的罪，找回失去的一切，兄弟二人踏上了寻找传说中的“贤者之石”的旅程。 几年后，一位右臂与左腿都是由“机械铠甲”替代的国家炼金术士出现在人们的眼前，他被称作“钢之炼金术师”。
大千世界，无奇不有。骊珠洞天中本该有大气运的贫寒少年，因为本命瓷碎裂的缘故，使得机缘临身却难以捉住。基于此，众多大佬纷纷以少年为焦点进行布局，使得少年身边的朋友获得大机缘，而少年却置身风口浪尖之上……
本作以星际旅行的科幻背景，讲述能够使用「以太齿轮」操纵重力的少年「四季」、没什么人气的实况主「蕾贝卡」，以及机械蓝猫「哈比」。他们将乘坐战列舰「EDNES ZERO」四处冒险，寻找能够实现一切愿望的神秘生命体「MOTHER」。
时值19世纪，名门特兰西家的家主亚洛斯，是个金发碧眼的美少年。在他刚出生没多久，便遭“精灵”掳走，直到数年前，才和“黑执事”克劳德，一起回到特兰西家。克劳德对主人绝对忠诚，总是陪伴在他身边，优雅达成各种任务。但是除了名字以外，没有人知道克劳德的过去与来历。而亚洛斯的叔叔，平时就懒得无厌、视财如命。为了自己的利益，竟开始对她们的身份起疑。
