由于父亲欠下了一屁股债人间蒸发，无家可归的女儿桃园奈奈生（三森铃子 配音）只得流浪街头。在这途中，奈奈生帮助了一位被恶狗追逐的男子，男子告诉奈奈生自己名叫御影（石田彰 配音），而在得知了奈奈生的遭遇后，他意外的提出将自己的住处让给奈奈生。一间荒芜的神社——这便是御影所说 的住处，奈奈生自觉上当，却也没有别的地方好去。更令她吃惊的是，御影竟然是神社的土地神，而如今，土地神的头衔，自然也随着住处转嫁到了奈奈生的头上。 莫名其妙的成为了土地神，而身边又出现了称她为“主人”的神使巴卫（立花慎之介 配音），奈奈生还未搞清楚状况，各路个性可爱又调皮的神灵就接二连三的降临到了她的身边。
全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年—— 拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。 在文明遭到毁灭的石之世界（STONE WORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们，从零开始创造文明—— 从石器时代到现代文明，绝对要赶上这科学史的200万年差距！ 前所未闻的创世冒险谭，就此开幕！
在广袤无垠的蛮荒仙界，修仙文化盛行，凡人皆以成为修士为荣。大学生陆航之从现代穿越而来，成为紫云镇上的一介凡人小厮，每天过着如履薄冰的日子，但他不肯认命，一直努力上进，想要摆脱现状，力争上游。后来，因为一次善举，他得到朱府大小姐朱抚琴和其师兄冷无涯的赏识，被招入朱府接受考验，若能通过，就可获得拜入玄心宗成为修士的机会。陆航之把握时机努力做事，认真完成朱抚琴交代的所有任务。在此期间，他偶得意外机缘，凭借五百年份的灵果，提升资质，备受朱抚琴重视。朱抚琴觉得引陆航之入玄心宗能为自己增加助力，便给予多番援手，助其快速成长。陆航之也不负所望，通过不屑努力，最终通过考验，成为玄心宗外门弟子。然而，这仅仅是一个开始，陆航之的志向远不止于此，他想要更进一步，只有晋升至内门弟子，才能获得更多资源，确保拥有足够实力站稳脚跟。
