在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
某天，家里蹲的啃老族绪山真寻一觉醒来发现自己变成了“女孩子”！？正当真寻不知道镜子里的美少女是自己而陷入混乱的时候，跳级进入大学的科学家妹妹绪山美波里出现了。她透露在饮料里加了一种奇怪的药物！ 真寻最近2年一直疯狂宅家玩小黄游，偶尔不得已才会工作！突然成为女孩子开始生活的真寻，对于厕所、浴室、裙子、胸罩等女人的生活完全不懂…并且他和美波里中学时期的同学穗月枫和其妹妹穗月椛认识。 真寻的日常生活逐渐热闹起来。在持续的苦难中，“前”哥哥的命运会如何...！
2008年4月からは第3シリーズである『全国大会篇 Final』が全4巻で発売された。 Vol.0： [0. 焼肉の王子様] Vol.1： [1. 頂上対決! ]、 [ 2. オレたちのやりかた] Vol.2： [3. 真昼に星は見えるか!? ]、 [4. 心をひとつに] Vol.3： [5. 最終決戦! 王子様VS神の子 ]、 [6. Dear Prince〜テニスの王子様達へ〜]
赌博的绝对规则，那就是，在一决胜负之后，会存在胜者与败者。胜者获得财富与荣誉，败者则被盖上落伍者的烙印，品味绝大的丧失，直到决出胜负为止的静寂当中，本能被挑起，欲望到达恍惚的境地。在资本主义的社会中，这正是人生的残酷缩影。为何人们要背负风险，被世界夺走心灵呢？这份疯狂的前方，人们所注视的事物是——让存在于现代社会的阶级制度崩溃！
新エネルギー資源の発見によって造られたメガフロート都市・ベイロンシティ。 そこで小さな会社を営む青年・シュウ。 彼は日頃の金遣いの荒さからひもじい生活を送っていた。 そんなシュウを心配し、彼の事務所兼自宅に通う一人の少女・キサラ。 彼女はベイロンシティ内の高校に通いながら、仕事の事務作業から家事まで面倒を見る。 そしてもう一人、シュウが以前に所属していた会社の先輩であり、 元恋人でもあるアヤノも彼のことを気にかけていた。 太平洋に浮かぶ人工島で巻き起こる
