主人公游城十代在前往决斗学院的入学考试途中，与传说的决斗者武藤游戏相遇，并接受了武藤游戏的一张卡片。但是十代最终迟到并错过了考试。为此十代恳求克洛诺斯教授让他通过考试，并由此展开了决斗者之路。
故事发生在炎帝、黄帝所在的蛮荒时代。正值群雄逐鹿中原之际，天下公认的领袖——神农帝去世，金、木、水、火、土各族群雄皆蠢蠢欲动。波涛暗涌的时代中，少年拓拔野横空出世，在机缘巧合下得到了神农帝临终传承，开始了一段惊心动魄的传奇历程。
以室町时代为舞台，讲述了后来被称为世阿弥的美少年“鬼夜叉”的故事。在一切以技艺为重的父亲观阿弥身边长大，鬼夜叉始终无法理解人类为何会享受艺术与表演。某一天，他在村子边缘的一户民宅中，看见一名唱歌跳舞的女子，竟不由自主地觉得很好……好奇心旺盛的鬼夜叉在与他人的相遇中学会欢笑与哭泣，直面自身的软弱，一边体会无常的人世，一边逐渐孕育出一种全新的舞蹈形式。
双眼失明的少年库诺的目标，就是用水系魔术做出新的双眼。学习魔法仅仅五个月，就超越教师实力的库诺，在这前所未有的挑战中，更加绽放了才能！ 用魔力感知周遭的色彩、透过水系魔术的应用，制作出怀炉与敷布，甚至只用初级魔术就重现了一只猫──其技术与构思，连宫廷魔术师都瞠目结舌，实力受到赏识的库诺，就此成为拥有极致手艺的魔技师的弟子！？ 以好奇心开拓世界，天才少年的发明奇幻故事！
