Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
打倒“妖神颂五力”的三年后，马场柠檬已经是国中生。某日，阿拉拉城空中突然出现了巨大奇怪物体…
图书管理员安藤夏（名冢佳织 配音）是一名文学少女，年近30的她居然从来没有谈过恋爱，而所谓的亲密体验更是无从谈起。公司勤务人员今河骏（下野紘 配音），标准的工科男，也是标准的30岁老处男。这两个毫无经验的“剩斗士”的命运，被四个调皮可爱的“性爱之神”连结在了一起。超级 自恋的大五郎（置鲇龙太郎 配音）和其弟马卡龙（渡部优衣 配音）降临在了今河骏的身边，坚定的要帮他展开破处之旅。另一边，多话又婆妈的小彼（喜多村英梨 配音）带着她的妹妹小空（喜多村英梨 配音）来到了安藤夏的身边，在神灵的帮助下，这对男女的命运会如何发展呢？
