由于两位假面骑士的活跃，邪恶组织·杰鲁修卡被消灭，但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动，而受到该邪恶组织的追杀，之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造，但二人知道改造人的悲哀，而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机，志郎舍命相救，被机关所伤而奄奄一息，为了救他一命，1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3。
天地是万物众生的客舍，光阴是古往今来的过客。苍天残面张开诡异之眼，所视之处生灵涂炭，化为永恒的禁区。末世之中，因果随行，死地后生。
个性活泼开朗有时候显得有些大大咧咧的水无月遥（田村由加莉 配音）、成熟稳重颇具大小姐风范的神无月葵（能登麻美子 配音）、从意大利转学而来的天才少女叶月胡桃（钉宫理惠 配音），活泼可爱的三人平日里在学校中是无话不谈的好友，过着平凡的校园生活，但每当夜晚来临，她们便会变身成为拥有超能力的魔法少女。 三人的目标，是寻找价值连城的天使像，邪恶而又贪婪的地下拍卖组织Black auction得到了它，企图通过它来牟取暴利。成绩优异的学生会长如月唯人（桧山修之 配音）、随叫随到的万能管家长月平之丞（清川元梦 配音），是他们在背后默默的支持着少女们。
人类最大的危机，大崩坏十年后的世界。 舞台是象征复兴的巨大学园都市アカデミア。 虽然学生的生活非常快乐，可是却无法改变，也不能改变自己。 一个空虚的度过每一天的女子高中生「白鸟空（しらとりくう）」。 她不时会梦见相同的“梦”。 来迎接自己的王子的“梦”…… 学园中的学生们都满腔热情地期待着学园祭。 在她的面前，“梦”见了好几次的王子出现了。 这次不是梦，而是现实。 自称是「绫小路（あやのこうじ）京四郎」的他在天空中说着和梦里相同的话。 「一起…走吧」 两人的相遇到底有什么样的意义？ 「神无月的巫女」「圆盘皇女」的原作者创作的新故事！ 豪华场面学园浪漫巨篇！！
人气高中生矢口八虎觉得生活很无聊，在从一副绘画中找到灵感后，他纵身投入了美丽却又无情的艺术世界。
