在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
柏木空（田村睦心 配音）是一名平凡的男子高中生，因为父亲是一位冒险家，常常不在家，因此，从很小的时候起柏木空就开始独立生活，变得非常擅长料理家事。这一天，柏木空收到了父亲从埃及寄来的包裹，打开包裹后，一个小小的木乃伊出现在了柏木空的面前，看着这个瑟瑟发抖的迷之生物，柏木空哭笑不得。 就这样，柏木空开始了和木乃伊一起的生活，肩负起了照顾小木乃伊的职责。之后，更多奇形怪状的生物出现在柏木空的身边——个性暴躁贪吃又懒惰的可尼、成熟稳重智商超群的阿勇。
前世叶云飞天资过人，但体内武脉突然关闭，无法练武，遭遇了家族内部的奚落，未婚妻的私通背叛，各家族的围剿，让少年叶云飞众叛亲离，好友被欺凌、挚爱伤心离开、父亲惨烈战死。好在云游路过的紫圣真君将他收入门下，叶云天成长为有史以来最年轻的天帝，却在渡劫时遭遇偷袭，重生回一切转折 发生的武脉尽失之时，却也是热血少年时代。 再次遇到旧日的亲人、好友、恋人，面对熟悉的一切，一代天帝叶云飞选择重新开始。体内尚存一缕天帝之魂，让前生记忆得以完好保存。内有名位之争，外有家族矿脉荣辱之责，举目帝国天骄聚集，四大宗派各为其势，天玄大陆豪杰并起，叶云飞熟谙这世界强者为尊的规则。在千年天帝记忆的帮助下，叶云飞的武功进步惊人，在武道世界之中不断成长，并带领家族、师门快速壮大。 安定时日未几，外来侵略者铁蹄来犯，叶云飞率众奋起反抗，保卫家园生生不息。 为了追求更高层次的武道之路，叶云飞离开家乡踏上了新的旅途，终成一代天帝。尝过太多落井下石、釜底抽薪，这一世必是神挡弑神，佛挡杀佛，横戈跃马，不负少年。
公元2011年，美国佛罗里达州。空条徐伦在与恋人开车兜风时遭遇交通事故，之后因被人陷害而获刑长达15年之久。 她被关押在州立绿海豚街重警备监狱——别名“水族馆”。被逼到绝望边缘的徐伦，却通过父亲托付给她的吊坠而觉醒了体内不可思议的力量。 “这个世界上存在着比死亡更可怕的事情 而且这件事情将必定在这家监狱发生。” 这是出现在徐伦面前的神秘少年所留下的讯息。难以理解的事件接连发生。前来探监的父亲空条承太郎口中讲述的恐怖事实，以及一个叫做“DIO”的名字……
机动战士高达SEED的系列作再开。这次除了我们大家熟悉的基拉（保志总一朗 配音）、阿斯兰（石田彰 配音）等人外，还有大量新角色的登场。而故事也将演变的更为复杂，冲突加剧，战争升级。 C.E.70年2月，“血染情人节”事件的辐射效应还在地球联合军和ZAFT中延续着。二者发动了数次对抗，伤及众多无辜百姓。C.E.71年6月，地球联合军居然不顾条约发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。这让少年真飞鸟（铃村健一 配音）在一瞬间失去了自己全部的亲人，而且都是在自己眼前。这件事对飞鸟的打击不小，让他这个无忧无虑的平凡少年，决定加入ZAFT。加入ZAFT，飞鸟遇到了许多挫折和坎坷，也看到了人性的残忍和无奈，最严峻的情况是自己内心始终笼罩着家人离去的阴影。飞鸟的成长在ZAFT正式开始。他和基拉、阿斯兰他们又会有怎样的交集呢？
