故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
十年，最后的最后
从美大毕业的社会新鲜人“石本美希”，为了逃离美术和相处多年的石膏像，决定以毫不相关的行业为就职对象，因此来到位於东京上野的艺能事务所“HOLBEIN”中工作。正当美希庆幸自己刚到职就被推荐成为新人偶像团体的经纪人时，她却没想到自己面对的竟然是由战神“马尔斯”、文青“麦地奇”、美男“荷米斯”及圣人“圣乔治”4人（!?）所组成的潮男团体“石膏男孩”，且他们正如团名所示，正好就是美希所厌恶的石膏像……
RWBY背景设定在类现代但是充满着超自然力量的世界。主要人物为四个拥有各自的特殊能力及武器的女孩，她们因各种原因聚在一起组成团队并接受训练，以对抗怪物、恶棍或其他类似的团体。 在这系列之前，人类为了生存，发起了对黑暗戮兽（Grimm）的战争，直到他们发现“尘晶”（Dust）可以被用作魔力来源，这让人类得以对抗它们，并建立了文明世界。
一度平静的斯沃罗夫小岛被弗林德·洛克伍德（比尔·哈德 Bill Hader 配音）的天才发明复食机所摧毁。最终他成功破坏复食机，并打算和山姆（安娜·法瑞丝 Anna Faris 配音）他们重建美好家园。这时候，弗林德最崇拜的偶像——丽芙公司老板切斯特 V（威尔·福特 Will Forte 配音）从天而降。切斯特是一个天才发明家，他的公司更是云集了全世界顶尖的科学家。切斯特邀请弗林德加入丽芙公司，并承诺带着岛民前往加利福尼亚，而他的公司将负责清理破败的小岛。为了成为幻想发明家，弗林德拼尽全力开展研发。与此同时，故乡却传来不好的消息。许多清理者被活着的食物所捕获，似乎复食机并未完全摧毁，并且朝着弗林德不曾预料的方向继续发展。 在切斯特的命令下，他和山姆、老爹以及其他伙伴们踏上了返乡的旅途，寻找解决麻烦的办法……
