在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
千金小姐吉儿遭到太子以莫须有的罪名悔婚并宣判死刑。就在临死之际，她竟重生到了10岁时订下婚约的那场派对！ 为了免于走上悲剧结局，她紧急向身后的人求婚，不料对方却是前生最大的敌人，也就是邻国（即将）入魔的皇帝·哈迪斯。 驰骋战场的军神大小姐在此刻重启人生！
克莱恩（愚者）在灰雾之上召开塔罗会时，聆听到了新的祈求。他将祈求者戴里克从神弃之地白银城拉上灰雾，通过戴里克的讲述了解到了这个神秘城邦白银城的故事。戴里克希望愚者可以帮助自己，拯救白银城，愚者予以了正向回应，并让戴里克从22张塔罗牌中选择自己的那张，戴里克选择了“太阳”作为自己的代号。之后，“倒吊人”阿尔杰提出了自己的交易需求，需要“正义”奥黛丽运用自己的人脉尽可能的在鲁恩国首都贝克兰德收集海盗七将军之一——齐林格斯的信息。并希望能获得愚者的帮助杀了齐林格斯。为此奥黛丽结识了佛尔思、休这二位非凡者，帮助寻找齐林格斯。最终，克莱恩找到自己的老师阿兹克，并借他的力量帮助塔罗会的各位完成了此事。
“红魔鬼”麦林的儿子麦当在地球上长大，他步入父亲后尘，决心找到被视为谎言的“彩虹海”，他依靠神奇力量突破邪恶组织“银河眼”设置的禁区，还邂逅了小星球国王咕咚。臣民因慑于炼丹师的阴谋，把咕咚变成兔子形状，可是他还是落入了炼丹师早已设置的圈套。麦当神勇地击败炼丹师，与咕咚驾飞船飞往彩虹海，可航线被星际联盟关闭，他们只好穿越死亡航线“魔鬼脚印”。历经艰险后，他们在天王星土著帮助下穿越冰雪迷宫，击败了强大的敌人，进入航行者遇难的雪流星。正当胜利在望之机，更大的危险出现了，太空海盗掳走了咕咚，海盗中还有功夫超群的英武少年米龙，麦当还能继续前进吗......
中華統一に向けた戦いが本格化 秦VS趙、全面戦争開幕
时光代理人第一季于7月9日完结，并宣布第二季制作决定
