在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
在豪派第7小学就读的王道游我，是整日发明无数唤为road的小学五年级生。对大人们所管理的决斗而感到无趣的游我，他想要做出谁都能享受的新规则。 有一天隔壁班级的rook带来了“决斗王”的传闻。等待充满兴趣的游我与rook到达的地方是，出现在含有深意的石碑前面的神秘人物... 要被承认为决斗王，必须在有限的时间内取得决斗胜利 “我想出的road，rush duel一定可行！” 游我与Rook两个少年，以新的决斗改变无趣世界的故事就要开始！
纪元前，在中国西方的秦国，年轻的千人将·信曾与已故的好友有着「天下的大将军」这一共同的梦想，而至今仍以此为目标。 此时，秦国成功攻陷了军事上最重要的据点山阳，并由此向中华统一又迈进了一步。但，对于可能改写七国势力图的这一手感到危机感的赵国天才军师·李牧，以楚国宰相·春申君为总大将，楚、赵、魏、燕、韩、齐六国兴起合纵军，开始进攻秦国！ 面对前所未有的危机，秦国集结所拥有的全部武力，迎击合纵军！！
羊狼意外误入奇幻山海界，邂逅众多上古奇兽，开启一场惊险的跨界冒险。旅途危机四伏，众人凭借彼此的默契协作，一次次化险为夷，逐步探寻隐秘的真相，厘清过往尘封旧事。没想到更大的危机步步逼近。最终羊狼携手伙伴同心协力，迎战强敌，打响守护山海界的最终决战。
散华礼弥（内田真礼 配音）本该是一个快乐活泼的女孩，可是与亡母过分想象的外貌激发了父亲散华团一郎（石冢运升 配音）超限度的溺爱和束缚，这让礼弥感到痛苦万分，甚至因此而失足从悬崖上摔落而死。没想到，礼弥的死却促成了她和偶然间邂逅的少年降谷千紘（木村良平 配音）之间的一段缘分。为了使爱猫复活，对僵尸极其狂热的降谷研发了一种怪异的药剂，他将这种药剂用在了已死的礼弥身上，没想到，礼弥居然以僵尸的形式重生了。 就这样，僵尸礼弥顺其自然的成为了降谷家的寄宿者，而为了使礼弥能够重新成为普通的女孩，降谷开始为了研究新的药剂而开始了奔波。
