艾可魔法少女由音乐，魔法，美少女三大元素构成，主要讲述了3位新海学院6年级的转学生，其实是来自神秘乐之世界的音乐魔法少女，她们在暗中对抗着邪恶的噪音魔王，悄悄的维护着世界的安宁与和平。
黒の地平を旅立ち、 次の大陸めざし航海していたビィトたちは 新たなる敵『魔牢獄の獄長バウス』の攻撃をうけ、 地図にのらない幻の大陸に漂着する。 そこには、 天撃を使う人々の暮らす町シャンティーゴがあり、 ビィトたちは暫くこの町で暮らすことになる。 シャンディーゴの領主の息子であるリオンは バスターになることを嫌い、 いつも、家出のチャンスをうかがっていた。 そんなリオンと出会ったビィトたちは リオンが秘めている謎の力、天力陣に助けられ バウスのあやつる囚人ヴァンデルたちと激しい闘いを繰り広げる。 リオンに興味をもつバウスの狙いとは？？ リオンのもつ力とは？？ ビィト戦士団とリオンの出会いが新たな冒険の扉を開く！！
