藤原拓海由于不败的战绩，必然会受到新的挑战。 《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。年轻的拓海在爱情上触了礁，在输给帝王车队的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，对自己和AE86产生了怀疑，AE86真的有足够的实力吗？ AE86的重生来自拓海的爸爸文太，他为AE86改装了赛车用引擎。同时，拓海遇到了同样是AE86的强劲对手秋山涉。有意思的是比赛规则是在同一赛道两车来回追赶，直到其中之一能超越对方为止，既要技术又考耐力。胜利让拓海继续接受这辆AE86和重拾信心回到车手的生涯。
故事跨越时空，从维京时代到幕府日本至二战时期，讲述三个铁血战士的勇猛事迹。人类的宿命是否将从此改写？
在东京的教会大学「立明教学园」上学的男主角水村心太，自少便成为孤儿的他，与自己幼驯染槙村千鹤一同上学，过著平凡普通的学园生活。可是某一天，一位罗马尼亚的混血女生岸本莉莉丝却突然转入「立明教学园」并使心太的生活产生了急剧的转变。原来，心太本身不但是一名吸血鬼猎人，而且还是雷莫德一族(就是吸血鬼猎人中最盛名者)的唯一继承者，与身份充满谜团的莉莉丝，两人的命运将使他们作出残酷的选择。
