网文作家赖晓光无意间进入了一个名为“上帝之手”的虚拟世界中。在这个奇幻的世界里，她变成了狼人大牛，并被卷入到了一起国宝失窃案中。为了调查真相，她不得不和羊王旺财一起踏上了旅程。
在一个充满明媚阳光的南方海岛上座落着一座美丽的蔬菜城市，在这座城市的郊区有一个富饶而神奇的蔬菜园。蔬菜园里有几个蔬菜精灵，他们是小白菜精灵——小翠、胡萝卜精灵——萝卜胡、南瓜精灵——南瓜尺、红辣椒精灵——红尖椒、茄子精灵——紫莹莹，他们快乐的生活在蔬菜园里。
故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中
