在某个古老村落的遗址深处，那一片禁止入内的区域里，存在着被口口相传为“窥之生厄、亵之招祟”的“不可触碰之物”。世代担任山神守护的三十木谷家的孩子——日向和薰，在一个暴风雨之夜靠近深山，遭遇了被称为“屋跨斑”的那个“存在”。然而两人竟毫不畏惧，反而将这位怪异称作“斑小姐”，并与之亲近起来……
电视动画《妖精的旋律》（Elfen Lied）改编自日本漫画家冈本伦的同名漫画。Elfen Lied在德语里，意思是妖精（Elf）的歌曲（Lied），此作品同时广泛的依据外文意译为《妖精的旋律》。一次突发事故，二觭人露西杀死警卫，逃出了研究所，并丧失了记忆，后被主角耕太和其表妹由香所收养。研究所方面害怕露西的能力会危害到人类的安全，先后派出特种部队和其他的二觭人进行抓捕，一场抓捕与反抓捕的“游戏”由此展开，同时露西和耕太之间的关系也渐露端倪……
该片讲述秋季之后的故事，从原作漫画第7集的剧情接续下去。除了小野寺小咲的妹妹小野寺春、小野寺春的好友小风和从美国飞来的宝拉·马可伊之外，其他还有千棘的母亲桐崎华等个性鲜明的新人物也将陆续登场。
令和末期，日本因全球核战影响走向衰败，大量难民涌入，更严重的病毒、大地震、苛政与饥荒接连发生，引发民众暴动，国家体制崩溃，人口锐减至原来的十分之一以下，文明水平倒退至明治初期，并分裂为“大和”“武凰”“圣夷”三国。约一百年后，大和历56年，生于爱媛郡的少年三角青辉登上历史舞台，一段以日本再统一为目标的时代故事由此展开。
