过去大战时期，日本帝国陆军为将咒术运用在军事上而建立阴阳寮，并派任传说中阴阳师安倍晴明的后裔、土御门家当家的天才阴阳师土御门夜光担任统领，成功缔造日本咒术界的改革，成为现代咒术之父。大战末期，处于败势的帝国陆军要求夜光实行大规模咒术仪式以挽回局势，但结果仪式失败，不仅做为执行者的夜光身亡，还强烈地扰乱首都东京的灵气，使东京百鬼夜行、妖魅纵横。直到了战后阴阳寮改名阴阳厅，负责处理日本各地－主要是东京－发生的灵力灾害，而阴阳师也因而活跃在现代的舞台之上。土御门春虎是个出生土御门家的少年，虽身为阴阳师名门后代，却毫无阴阳师才能，过着一般人的生活。某年夏天，春虎遇见了他的童年玩伴，也是土御门家的下任当家的少女夏目。过去曾允下承诺如今却分道而行的两人，在此刻相见之后，土御门的历史开始转动了起来......
本片讲述了一段跨越性别、跨越物种的爱情故事。 因为父母离婚，川内洲（梶裕贵 配音）自小与祖父一起生活。祖父去世那天，他一个人跑到海边哭泣，一不小心失足落水。洲被一个迷之美男子救了起来，却发现对方是一条人鱼！洲把人鱼带回家，还帮他改名为“ISAKI”（绿川光 配音）。因为与人 鱼 朝夕相处，曾经寂寞悲伤的洲渐渐地开朗起来，跟学校同学的关系也亲密起来。不久后，随着文化祭的临近，洲的学校生活越发忙碌充实起来。常常独自一人在家守候的人鱼伊佐木，觉得洲已经不再需要自己了。一天夜里，当洲回到家中，他发现人鱼不见了……
